乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区克隆及分子结构特征分析

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中文摘要：本研究旨在克隆乌蒙乌骨鸡酪氨酸酶(TYR)基因启动子区序列并解析其分子结构特征，为探究该基因调控乌蒙乌骨鸡乌质性状的分子机制提供参考。以乌蒙乌骨鸡血液基因组DNA为模板，设计 3 对特异性引物，通过PCR扩增、Sanger测序及序列拼接方法获得TYR基因启动子区序列;采用DNAStar Lasergene和MEGA 5。0 软件分别进行 15 个物种TYR基因启动子区序列相似性分析及系统进化树构建;利用生物信息学软件预测分析该序列核心启动子、调控元件、转录因子和CpG岛等分子结构特征。结果显示，乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区序列长 3 216 bp(Genbank登录号:ON49713457)，包括 5'侧翼区 2 858 bp和 358 bp部分外显子 1。乌蒙乌骨鸡与其他 14 个物种TYR基因相似性为 40。9%～99。9%，乌蒙乌骨鸡与原鸡、鹌鹑等鸡形目亲缘关系较近，与猪亲缘关系较远。-600～-59 bp可能为乌蒙乌骨鸡TYR基因候选核心启动子区域，5'侧翼区-523 bp处可能存在 1 个转录起始位点C，存在 1 个CAAT-box、3 个TATA-box、16 个E-box、2 个进化保守区域CR1 和CR2、5 个 5'侧翼区近端黑色素细胞特异性元件(p-MSE)，不存在CpG岛。乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区存在潜在的C/EBP-α、GATA-1、Sp1、Pdx1、TBP和NF-1 等转录因子。本研究成功克隆获得乌蒙乌骨鸡TYR基因启动子区序列，为解析该基因调控乌蒙乌骨鸡乌质性状的分子机制提供了理论依据。

作者：

宋兴超、王云艳、孟金柱、安清明、赵园园、吴震洋

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作者单位：

铜仁学院农林工程与规划学院,贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州铜仁 554300

关键词：

乌蒙乌骨鸡 TYR基因启动子区转录因子调控元件

出版年：

2024

DOI：

10.19556/j.0258-7033.20240327-01

中国畜牧杂志

中国畜牧兽医学会

中国畜牧杂志

CSTPCD北大核心

影响因子：0.704

ISSN：0258-7033

年,卷(期)：2024.60(12)