[目的]探索表征云南烟叶质量的关键指标,并明确各指标在不同质量档次烟叶中的差异.[方法]针对楚雄和丽江烟叶,采用唯一差别原则制备不同外观特征样品,进行外观和感官质量评价,以及常规化学成分和代谢组测定.采用随机森林分析筛选影响烟叶质量的关键质量指标,并以此对烟叶样品进行聚类分析.[结果](1)筛选出12个关键质量指标:品牌符合度、香气质、杂气、叶片结构、身份、油分、淀粉、总糖、总氮、酚酸、高级脂肪酸和氨基酸;(2)将烟叶样品分为3个质量类别:类1烟叶杂气较轻,香气质中偏上,品牌符合度好,叶片结构疏松性较好,身份中等,总糖含量较高,总氮和酚酸、高级脂肪酸、氨基酸类代谢产物含量较低;类3烟叶杂气有,香气质中等,品牌符合度一般,叶片结构疏松性最差,身份稍厚,总糖含量较低,总氮和酚酸、高级脂肪酸、氨基酸类代谢产物含量较高;类2烟叶绝大多数指标介于类1和类3之间;(3)叶片结构、身份和总糖与烟叶质量呈正相关,总氮和酚酸、高级脂肪酸、氨基酸类代谢产物含量与烟叶质量呈负相关.[结论]本研究结果明确了楚雄和丽江烟叶生产、收购、加工和配方应用等环节需重点关注的指标,为提高烟叶质量和工业适用性奠定基础.