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不同播期条件下大豆开花期性状的全基因组关联分析

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开花期是决定大豆生态适应性和产量的重要性状,研究大豆开花期的遗传规律,解析大豆开花调控的分子基础,对大豆品种适应性改良具有重要意义.本研究选用来自北方、黄淮海和南方三大生态区的87份中国品种及31份美国大豆品种,在北京进行春、夏季分期播种,获得10个播期环境下的开花期数据,并利用Illumina BARC-SoySNP6K iSelectBeadChip芯片对大豆品种进行SNP分型.通过群体结构分析、聚类分析和PCA分析,将供试大豆品种分为两个亚群.利用TASSEL软件PCA+K模型,结合5126个SNP标记,对开花期进行全基因关联分析,得到18个显著关联位点,其中14个位点在2个以上的环境中稳定表达,4个位点只在单一环境中被检测到,表明其受光温环境影响较大.18个位点中有11个尚未见报道,分别位于3、4、5、9、10、14、16和17号染色体上,可能存在控制大豆开花期的新基因.通过对显著关联位点进行预测,共发现31个候选基因,其中有2个(Glyma10g36600和Glyma19g37890)已在此前的研究中被证明与大豆开花有关,而Glyma03g33470、Glyma11g15650、Glyma05g01510和Glyma19g07162与拟南芥中相关的开花调控基因同源,推测这4个基因在大豆中也参与开花调控.
Genome-wide association analysis of soybean flowering time under different sowing dates

宋晓宇、毛婷婷、王立伟、刘丽凤、李晓那、孙石、韩天富

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东北农业大学农学院,黑龙江 哈尔滨,150030

中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081

鲁东大学,山东 烟台,264025

大豆 播期 开花期 全基因组关联分析 候选基因

国家重点研发计划国家现代农业产业技术体系建设专项中国农业科学院农业科技创新工程

2017YFD0101400CARS-04

2018

中国油料作物学报
中国农业科学院油料作物研究所

中国油料作物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.296
ISSN:1007-9084
年,卷(期):2018.40(4)
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