中国养兔2020，Issue(1) ：8-12.

天府黑兔APOA4基因多态性及生物信息学分析

Genetic Polymorphism and Bioinformatics Analysis of APOA4 Gene in Tianfu Black Rabbits

李彦宏 罗鑫茂 贾先波 陈仕毅 王杰 赖松家
中国养兔2020，Issue(1) ：8-12.
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天府黑兔APOA4基因多态性及生物信息学分析

Genetic Polymorphism and Bioinformatics Analysis of APOA4 Gene in Tianfu Black Rabbits

李彦宏 1罗鑫茂 1贾先波 1陈仕毅 1王杰 1赖松家1
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作者信息

  • 1. 四川农业大学动物遗传育种研究所,成都611130
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摘要

为探究载脂蛋白A-Ⅳ (Apolipoprotein A-Ⅳ,APOA4)在天府黑兔群体中的遗传效应.本试验采用直接测序法检测天府黑兔APOA4基因第3外显子编码区内的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并结合生物信息学软件分析其蛋白结构域和mRNA二级结构.结果 表明APOA4基因第3外显子编码区内检测发现3个遗传变异位点(c.1459 A→G、c.1648 G→A和c.1843 T→C)均为同义突变,位于APOA4的Pfam:Apolipoprotein蛋白结构域中,处于完全连锁状态,并选择c.1459 A→G位点进行遗传效应分析位,PIC=0.3447为中度多态(0.25＜PIC＜0.50).APOA4基因c.1459 A→G位点在肉品质选育中可能具有较高的潜力,以此为培育肉兔新品种提供分子依据.

关键词

APOA4基因/多态性/生物信息学/天府黑兔

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基金项目

国家兔产业技术体系(CARS-43-A-2)

出版年

2020
中国养兔
江苏省畜牧总站,中国畜牧业协会兔业分会,江苏畜牧兽医职业技术学院

中国养兔

影响因子：0.171
ISSN：1005-6327
被引量1
参考文献量5
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