中国养兔2021，Issue(1) ：4-7,15.

飞行时间质谱法检测肉兔IGF-IR基因的多态性

Rapid Detection of SNPs in Meat Rabbit IGF-IR Gene by Matrix-assisted Laser Desorption/lonization Time-of-Flight Mass Spectrometry

梅秀丽 邝良德 郭志强 李娟 黄邓萍 谢晓红 雷岷 李丛艳
中国养兔2021，Issue(1) ：4-7,15.
✕
  • NETL
  • NSTL
  • 维普
  • 万方数据

飞行时间质谱法检测肉兔IGF-IR基因的多态性

Rapid Detection of SNPs in Meat Rabbit IGF-IR Gene by Matrix-assisted Laser Desorption/lonization Time-of-Flight Mass Spectrometry

梅秀丽 1邝良德 1郭志强 1李娟 2黄邓萍 1谢晓红 1雷岷 1李丛艳1
扫码查看

作者信息

  • 1. 四川省畜牧科学研究院,成都 610066;动物遗传育种四川省重点实验室,成都 610066
  • 2. 四川省成都市农林科学院畜牧研究所,成都 611130
  • 折叠

摘要

应用MassARRAY单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)基因分型法检测肉兔胰岛素样生长因子1 受体(Insulin-like Growth Factor 1 Receptor,IGF-IR)的多态性(SNPs),为今后建立肉兔辅助标记选择奠定基础.以家兔IGF-IR基因序列为模板,利用PCR扩增测序法筛查了肉兔IGF-IR基因的9个SNPs.为进一步验证筛选的准确性,应用MALDI-TOF-MS针对384只肉兔检测了5个SNPs.结果显示,平均检出率为98％,能够准确检测出3种常见的基因型.所检SNP位点的平均最小等位基因频率(MAF)为0.45,平均多态信息含量(PIC)为0.36.本研究运用的方法快速、可靠、准确度高,为以后开展肉兔生长性状基因的SNP分型和检测等奠定了基础.

关键词

肉兔/IGF-IR基因/飞行时间质谱/SNPs

引用本文复制引用

基金项目

出版年

2021
中国养兔
江苏省畜牧总站,中国畜牧业协会兔业分会,江苏畜牧兽医职业技术学院

中国养兔

影响因子：0.171
ISSN：1005-6327
被引量1
参考文献量6
段落导航相关论文