摘要
基因组选择是目前最先进的畜禽育种技术,但在家兔上还未见相关报道.本研究模拟了一个家兔选育群体,设计4个微效多基因控制性状(其遗传力分别为0.05、0.10、0.25和0.40),共开展8个世代的人工选育试验.在选育群的第6和第7世代,随机选择500、1 000、1 500或2 000只个体组建用于训练遗传评估模型的训练集,在第8世代中随机选择500只个体作为验证集,训练集和验证集中的所有个体进行50 K SNP分型;在此基础上,比较分析了基于系谱信息的传统最佳线性无偏估计(PBLUP)、基于基因组信息的基因组最佳线性无偏估计(GBLUP)、和基于系谱和基因组信息的单步基因组最佳线性无偏估计(ssGBLUP)3种遗传评估模型在育种值估计上的准确性.结果发现,当训练集样本数达到1500只时,GBLUP方法在所有遗传力情况下均优于传统的PBLUP方法,能提高约30％的准确性.当使用ssGBLUP方法时,即使在遗传力为0.05和训练集大小为500只的情况下,与PBLUP方法相比其估计准确性也具有明显地提高;随着训练集大小的增加,ssGBLUP方法估计准确性具有显著地提高,增幅可以达到1倍.因此,认为在家兔上实施基因组选择具有很强的可行性,在前期阶段可以对小规模样本进行基因分型,然后使用ssGBLUP遗传评估模型进行育种值估计.
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