目的 总结分析医学科技计划项目开展的现状、存在的亮点及问题,提出相应的发展策略建议.方法 本研究采用横断面研究设计,分析2016—2021年深圳市立项的医学科技计划1880项基本情况以及2016—2017年已结题558个项目的绩效产出数据.结果 2016—2021年度医学科技计划项目共立项资助1880项,共依托97家单位,总资助金额累计10亿,增长百分比93.9%.基础研究专项占资助项目总数93.4%,资助总金额6.1亿,占总项目资助金额60.3%.医学科技计划中医疗卫生机构类项目总计1692项,其中基层机构及区级医疗机构(未定级、一级、二级)资助力度较小,立项比例为7.2%,资助金额仅占医疗卫生机构类总金额3.0%.2016—2017完成结题项目558项,绩效指标包括发表文章、培养人才、科技奖以及专利申请数量,总计培养人才762名,申请专利448项,专利授权184项,发表论文2061篇.结论 医学科技计划项目加强规划临床研究专项,建立多层级临床研究中心体系,完善科技项目管理各个环节机制、分层分类管理,强化科技成果转化应用四方面的支撑,逐步转向临床研究新方向.