用分子生物学方法检测军团菌已经被越来越多的专家和实验室所认可,其中以基因测序为基础的军团菌鉴定和分型方法是目前认为最客观、准确且具有较好重复性的方法.军团菌常用的测序靶点有16S rRNA基因、mip基因、rpoB基因、dotA基因、23S5S rDNA基因间隔区,5SrRNA基因、gyrA基因、dnaJ基因、rnpB基因等位点,但观其分型效果、重复性、流行病学可信度及分辨能力,最具优势的是欧洲军团菌感染工作组(EWGLI)提出的利用7个基因(flaA,mornpS,pilE,asd,mip,proA,neuA)测序对军团菌进行分型.随着基因测序技术和序列数据库的发展,基因测序在军团菌的鉴定、分型中发挥着越来越重要的作用.本文对基因测序鉴定军团菌的技术方法及其优缺点和实用价值做一简要概述.