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蓖麻PIP5K1基因克隆、生物信息学及功能分析

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蓖麻PIP5K1 基因在植物生长发育和抗逆过程中起重要作用.为探究蓖麻PIP5K1 基因在蓖麻物种中的生物学功能和不同时期雌性植株中的表达情况,以aLmAB2 品系的蓖麻花序为试验材料,克隆PIP5K1 基因,对该基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,并对PIP5K1 基因在不同时期雌性系植株的表达模式进行分析.结果表明:从蓖麻花序轴顶端将总RNA提取出来,并将其反转录成cDNA,克隆后得到一个全长为 2325bp的PIP5K1 基因片段,经测序后比对这一基因序列和NCBI参考基因序列相同.对该基因所编码蛋白展开生物信息学分析,确定PIP5K1 基因所编码蛋白质的氨基酸等电点为 8.85,氨基酸数目为 774,分子量大小为 87967.37Da,是一种亲水性稳定蛋白;无跨膜螺旋区,属于非跨膜蛋白;蛋白质二级结构由α螺旋、β转角、伸展链及无规卷曲构成;三级结构与二级结构预测结果一致;与同属于大戟科的木薯亲缘关系较近,与其他科亲缘关系较远.qRT-PCR分析表明,PIP5K1 在标雌系、单雌系、两性系花序中均有不同程度的上调和下调,推测PIP5K1 基因参与蓖麻花序发育的调控.本研究为探究PIP5K1基因促进蓖麻植株的生长发育机制奠定了理论基础.
Cloning,Bioinformatics Analysis and Functional Analysis of Castor PIP5K1 Gene

李明静、袁朴芳、罗蕊、尹明达、王志妍、户雪妹、顾晓慧、黄风兰

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内蒙古民族大学生命科学与食品学院,通辽 028000

内蒙古自治区蓖麻育种国家民委重点实验室/内蒙古自治区蓖麻育种与综合利用重点实验室/蓖麻产业技术创新内蒙古自治区工程研究中心/内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心,通辽 028000

蓖麻 PIP5K1 基因克隆 生物信息学分析 功能分析

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2024

10.19462/j.cnki.zgzy.20231103004

中国种业
中国农业科学院作物科学研究所,中国种子协会

中国种业

影响因子：0.356
ISSN：1671-895X
年,卷(期)：2024.(1)
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