中国种业2024，Issue(1) ：88-94.DOI:10.19462/j.cnki.zgzy.20231103004

蓖麻PIP5K1基因克隆、生物信息学及功能分析

Cloning,Bioinformatics Analysis and Functional Analysis of Castor PIP5K1 Gene

李明静 袁朴芳 罗蕊 尹明达 王志妍 户雪妹 顾晓慧 黄风兰
中国种业2024，Issue(1) ：88-94.DOI:10.19462/j.cnki.zgzy.20231103004
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蓖麻PIP5K1基因克隆、生物信息学及功能分析

Cloning,Bioinformatics Analysis and Functional Analysis of Castor PIP5K1 Gene

李明静 1袁朴芳 1罗蕊 1尹明达 1王志妍 1户雪妹 1顾晓慧 1黄风兰2
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作者信息

  • 1. 内蒙古民族大学生命科学与食品学院,通辽 028000
  • 2. 内蒙古民族大学生命科学与食品学院,通辽 028000;内蒙古自治区蓖麻育种国家民委重点实验室/内蒙古自治区蓖麻育种与综合利用重点实验室/蓖麻产业技术创新内蒙古自治区工程研究中心/内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心,通辽 028000
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摘要

蓖麻PIP5K1 基因在植物生长发育和抗逆过程中起重要作用.为探究蓖麻PIP5K1 基因在蓖麻物种中的生物学功能和不同时期雌性植株中的表达情况,以aLmAB2 品系的蓖麻花序为试验材料,克隆PIP5K1 基因,对该基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,并对PIP5K1 基因在不同时期雌性系植株的表达模式进行分析.结果表明:从蓖麻花序轴顶端将总RNA提取出来,并将其反转录成cDNA,克隆后得到一个全长为 2325bp的PIP5K1 基因片段,经测序后比对这一基因序列和NCBI参考基因序列相同.对该基因所编码蛋白展开生物信息学分析,确定PIP5K1 基因所编码蛋白质的氨基酸等电点为 8.85,氨基酸数目为 774,分子量大小为 87967.37Da,是一种亲水性稳定蛋白;无跨膜螺旋区,属于非跨膜蛋白;蛋白质二级结构由α螺旋、β转角、伸展链及无规卷曲构成;三级结构与二级结构预测结果一致;与同属于大戟科的木薯亲缘关系较近,与其他科亲缘关系较远.qRT-PCR分析表明,PIP5K1 在标雌系、单雌系、两性系花序中均有不同程度的上调和下调,推测PIP5K1 基因参与蓖麻花序发育的调控.本研究为探究PIP5K1基因促进蓖麻植株的生长发育机制奠定了理论基础.

关键词

蓖麻/PIP5K1/基因克隆/生物信息学分析/功能分析

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基金项目

国家自然科学基金(31860071)

教育部新农科研究与改革实践项目(2020114)

内蒙古自治区自然科学基金面上项目(2021MS03008)

内蒙古自治区草原英才创新团队—蓖麻分子育种研究创新人才团队滚动支持计划(2022)()

国家民委高等教育教学改革研究项目(2021)(21082)

内蒙古自治区科技厅立项内蒙古自治区蓖麻育种与综合利用重点实验室建设项目()

内蒙古民族大学自治区直属高校基本科研业务费项目(2022)(237)

内蒙古民族大学自治区直属高校基本科研业务费项目(2023)(225)

内蒙古民族大学自治区直属高校基本科研业务费项目(2023)(227)

内蒙古民族大学自治区直属高校基本科研业务费项目(2023)(243)

内蒙古民族大学自治区直属高校基本科研业务费项目(2023)(244)

内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心开放基金(MDK2021011)

内蒙古自治区蓖麻产业协同创新中心开放基金(MDK2022014)

出版年

2024
中国种业
中国农业科学院作物科学研究所,中国种子协会

中国种业

影响因子：0.356
ISSN：1671-895X
参考文献量12
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