中国中医药信息杂志2021,Vol.28Issue(3) :19-26.DOI:10.19879/j.cnki.1005-5304.202003171

基于计算机辅助药物设计探究扶正避瘟方预防新型冠状病毒感染的物质基础及分子机制

Exploration of Material Basis and Molecular Mechanism for Preventing SARS-CoV-2 Infection by Fuzheng Biwen Prescription Based on Computer Aided Drug Design

靳晓杰 王菲 毛建军 王燕如 关瑞宁 刘东玲 魏本君 李亚玲 张利英 张志明 刘永琦
中国中医药信息杂志2021,Vol.28Issue(3) :19-26.DOI:10.19879/j.cnki.1005-5304.202003171

基于计算机辅助药物设计探究扶正避瘟方预防新型冠状病毒感染的物质基础及分子机制

Exploration of Material Basis and Molecular Mechanism for Preventing SARS-CoV-2 Infection by Fuzheng Biwen Prescription Based on Computer Aided Drug Design

靳晓杰 1王菲 2毛建军 2王燕如 3关瑞宁 2刘东玲 1魏本君 3李亚玲 3张利英 3张志明 4刘永琦5
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作者信息

  • 1. 甘肃中医药大学药学院,甘肃兰州 730000;甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室,甘肃 兰州 730000
  • 2. 甘肃中医药大学药学院,甘肃兰州 730000
  • 3. 甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室,甘肃 兰州 730000
  • 4. 甘肃中医药大学附属医院,甘肃兰州 730000
  • 5. 甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室,甘肃 兰州 730000;甘肃中医药大学敦煌医学与转化教育部重点实验室,甘肃兰州 730000
  • 折叠

摘要

目的 从抑制病毒感染不同靶点的选择性、调控机体免疫因子的角度出发,系统研究扶正避瘟方预防新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的物质基础及分子机制.方法 采用计算机辅助药物设计中的同源模建、分子对接等方法,对扶正避瘟方中各药味的化合物进行基于分子对接的虚拟筛选.运用靶点反向预测及其KEGG通路,分析方中健脾药白术对机体抵御病毒的潜在靶点和分子机制,并进行分子对接验证.结果 扶正避瘟方中阻断SARS-CoV-2入侵的活性成分有84个,连翘、生姜、荷叶、黄芪对SARS-CoV-2感染具有针对性阻断作用.对不同冠状病毒阻断机制的差异性分析显示,荷叶对SARS-CoV的选择性高于SARS-CoV-2,生姜则对SARS-CoV-2更具针对性.白术缺乏直接阻断成分,但白术内酯Ⅲ、苍术酮和茅苍术醇等与免疫靶点大麻素受体2(CB2)有较强的潜在结合能力.结论 扶正避瘟方中连翘、荷叶的单体成分连翘脂苷A、(-)-儿茶素、熊竹素等可作为潜在抗病毒成分进一步开发,白术中的白术内酯Ⅲ等可能通过结合免疫靶点CB2发挥免疫调控作用.

关键词

扶正避瘟方/计算机辅助药物设计/新型冠状病毒/同源模建/靶点反向预测/大麻素受体2

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基金项目

甘肃省科技计划(20YF2FA017)

甘肃中医药大学新型冠状病毒感染的肺炎应急防治专项(2020XGZX-02)

甘肃省重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室新型冠状病毒防治研究专项开放基金(FZYX20-1)

甘肃省重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室新型冠状病毒防治研究专项开放基金(FZYX20-2)

甘肃省重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室新型冠状病毒防治研究专项开放基金(FZYX20-3)

敦煌医学与转化教育部重点实验室开放基金(DHYX18-09)

出版年

2021
中国中医药信息杂志
中国中医科学院中医药信息研究所

中国中医药信息杂志

CSTPCDCSCD
影响因子:0.889
ISSN:1005-5304
被引量5
参考文献量11
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