中国中医药信息杂志2021,Vol.28Issue(7) :27-34.DOI:10.19879/j.cnki.1005-5304.202005095

六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

Integration Analysis of lncRNA-miRNA-mRNA Transcriptional Network of Liuwei Dihuang Decoction in Treating Neonatal Hypoxic-ischemic Encephalopathy

陈博威 郑飘 易健 刘柏炎
中国中医药信息杂志2021,Vol.28Issue(7) :27-34.DOI:10.19879/j.cnki.1005-5304.202005095

六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

Integration Analysis of lncRNA-miRNA-mRNA Transcriptional Network of Liuwei Dihuang Decoction in Treating Neonatal Hypoxic-ischemic Encephalopathy

陈博威 1郑飘 1易健 2刘柏炎3
扫码查看

作者信息

  • 1. 湖南中医药大学,湖南长沙410208
  • 2. 湖南中医药大学第一附属医院,湖南长沙410007
  • 3. 湖南中医药大学,湖南长沙410208;益阳医学高等专科学校,湖南益阳413000
  • 折叠

摘要

目的 运用生物信息学方法挖掘六味地黄汤治疗新生儿缺血缺氧性脑病(HIE)的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络,探讨其作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘六味地黄汤活性成分及预测靶点,从GEO、miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库挖掘HIE差异表达的lncRNAs、miRNAs及mRNAs,使用R语言及Perl软件筛选六味地黄汤治疗HIE的关键lncRNAs、miRNAs及mRNAs,借助Cytoscape3.7.0软件与STRING数据库构建活性成分-靶点网络、三元转录网络及蛋白互作网络,并进行GO功能及KEGG通路富集分析,最后予以分子对接评估.结果 挖掘出六味地黄汤33个活性成分,33个靶点与HIE相关.得到由13个关键lncRNAs、20个关键miRNAs及33个关键mRNAs构成的三元转录网络,这些靶点主要通过PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路及IL-17信号通路等发挥抑制氧化应激、炎症反应及凋亡等作用.结论 六味地黄汤通过多靶点、多通路协同治疗HIE,可为相关临床及实验研究提供依据.

关键词

六味地黄汤/新生儿缺血缺氧性脑病/lncRNA/miRNA/竞争性内源RNA/生物信息学/网络药理学/分子对接

引用本文复制引用

基金项目

出版年

2021
中国中医药信息杂志
中国中医科学院中医药信息研究所

中国中医药信息杂志

CSTPCDCSCD
影响因子:0.889
ISSN:1005-5304
被引量3
参考文献量16
段落导航相关论文