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大柴胡汤治疗肝细胞癌lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

Integration Analysis of lncRNA-miRNA-mRNA Transcriptional Network in the Treatment of Hepatocellular Carcinoma with Dachaihu Decoction

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目的 挖掘大柴胡汤治疗肝细胞癌的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,探讨其抗肝癌作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GEO、miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库获取大柴胡汤的活性成分、预测靶点及肝细胞癌的差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)、微小RNA(miRNAs)和mRNAs,通过R语言和Perl软件筛选大柴胡汤治疗肝细胞癌的关键lncRNAs、miRNAs、mRNAs.采用Cytoscape3.7.0软件和STRING数据库构建活性成分-靶点网络、lncRNA-miRNA-mRNA转录网络和蛋白相互作用网络,进行GO和KEGG富集分析,并予分子对接验证,进行整合分析.结果 得到大柴胡汤治疗肝细胞癌的97个有效成分和42个靶点,构建了由19个关键lncRNAs、23个关键miRNAs和42个关键mRNAs组成的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络.富集分析结果显示,这些靶基因参与了肿瘤的生存、凋亡、自噬、氧化应激、蛋白激酶等生物学过程,主要通过PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和TNF信号通路等发挥作用.结论 大柴胡汤治疗肝细胞癌具有多成分、多靶点、多途径协同作用特点,可为相关研究提供依据和方向.

郑飘、陈博威、宁迪敏、肖唯、田雪飞

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湖南中医药大学中西医结合学院,湖南 长沙 410208

湖南中医药大学第一附属医院,湖南 长沙 410007

中南大学湘雅医院中西医结合研究所,湖南 长沙 410008

肝细胞癌 大柴胡汤 转录网络 生物信息学 网络药理学 分子对接

湖南省自然科学基金湖南省研究生科研创新项目湖南中医药大学中西医结合一流学科开放基金

2020JJ4066CX201905412018ZXYJH03

2021

10.19879/j.cnki.1005-5304.202104055

中国中医药信息杂志
中国中医科学院中医药信息研究所

中国中医药信息杂志

CSTPCDCSCD
影响因子：0.889
ISSN：1005-5304
年,卷(期)：2021.28(12)
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