科学评价科技创新绩效有助于合理配置脐橙产业科技资源,加快脐橙产业科技创新,推动赣南脐橙产业转型升级.基于产业价值链视角,以国家脐橙工程技术研究中心作为科技创新主体,采用案例研究法,借助定量和定性指标,评价科技创新驱动赣南脐橙产业升级的绩效水平,探索国家脐橙工程技术研究中心在助力赣南脐橙产业转型升级中的实践模式.研究表明,国家脐橙工程技术研究中心在发展过程中通过科技项目"强链"、研发创新"补链"、服务推广"延链",有效助力赣南脐橙产业转型升级,投人产出达到了DEA有效状态,在知识创新、技术创新和政企服务方面都取得了一定成效,但在与地方政府、企业开展的多层次合作仍有很大的发展空间,在综合分析的基础上,提出应加强科研人员对科技成果的实践应用研究,改革科研人员职称评定的考核体系,加大高校开展校企合作、科技服务地方的力度.