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TUB2基因作为葡萄白粉病菌DNA条形码的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of TUB2gene for DNA barcoding of the causal pathogen of powdery mildew on grape

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葡萄白粉病是葡萄栽培中最重要的真菌病害之一,其病原物为专性寄生活体营养型葡萄白粉菌(Erysiphe necator).分析了TUB2基因是否可以作为葡萄白粉菌及其近缘种菌株的DNA条形码,结果显示,TUB2基因在白粉菌属上具有明显的种间和种内遗传变异间距(Barcoding Gap),系统树分析显示TUB2基因对葡萄白粉菌及其近缘种具有有效的区分能力,因此认为TUB2基因可作为葡萄白粉病菌诊断的理想DNA条形码候选片段.
Grape powdery mildew is one of the most important fungal diseases in viticulture,and its pathogen is Erysiphe necator.In this study,we investigated whether the TUB2 gene could serve as a DNA barcoding differentiating Erysiphe necatorand its closely-related species.The results revealed that the TUB2 genes show distinct discrepancies between intra-and inter-specific genetic distances in Erysiphesepeices.The diversity of the TUB2genes can effectively distinguish Erysiphe necatorand its closely-related species via phylogenetic study.Therefore,the TUB2region could be recommended as the ideal candidate DNA barcoding for the diagnose of grape powdery mildew.

TUB2Erysiphe necatorDNA barcodingbioinformatics

何瑞玒、付海滨、尹琪、李鑫、宋晓昕、金璐、李辉

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TUB2 葡萄白粉菌 DNA条形码 生物信息学

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2024

中国果树
中国农业科学院果树研究所

中国果树

CSTPCD
影响因子:0.45
ISSN:1000-8047
年,卷(期):2024.(7)
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