首页|TUB2基因作为葡萄白粉病菌DNA条形码的生物信息学分析

TUB2基因作为葡萄白粉病菌DNA条形码的生物信息学分析

扫码查看
葡萄白粉病是葡萄栽培中最重要的真菌病害之一,其病原物为专性寄生活体营养型葡萄白粉菌(Erysiphe necator).分析了TUB2基因是否可以作为葡萄白粉菌及其近缘种菌株的DNA条形码,结果显示,TUB2基因在白粉菌属上具有明显的种间和种内遗传变异间距(Barcoding Gap),系统树分析显示TUB2基因对葡萄白粉菌及其近缘种具有有效的区分能力,因此认为TUB2基因可作为葡萄白粉病菌诊断的理想DNA条形码候选片段.
Bioinformatics analysis of TUB2gene for DNA barcoding of the causal pathogen of powdery mildew on grape
Grape powdery mildew is one of the most important fungal diseases in viticulture,and its pathogen is Erysiphe necator.In this study,we investigated whether the TUB2 gene could serve as a DNA barcoding differentiating Erysiphe necatorand its closely-related species.The results revealed that the TUB2 genes show distinct discrepancies between intra-and inter-specific genetic distances in Erysiphesepeices.The diversity of the TUB2genes can effectively distinguish Erysiphe necatorand its closely-related species via phylogenetic study.Therefore,the TUB2region could be recommended as the ideal candidate DNA barcoding for the diagnose of grape powdery mildew.

TUB2Erysiphe necatorDNA barcodingbioinformatics

何瑞玒、付海滨、尹琪、李鑫、宋晓昕、金璐、李辉

展开 >

宁夏葡萄酒与防沙治沙职业技术学院,银川 750001

沈阳海关技术中心

大连海关技术中心

东港海关综合技术服务中心

展开 >

TUB2 葡萄白粉菌 DNA条形码 生物信息学

宁夏回族自治区教育厅高等学校科学研究项目海关总署科研项目大连海关科研项目"十四五"国家重点研发计划课题

NYG20222322023HK0832023DK012021YFD1400100

2024

中国果树
中国农业科学院果树研究所

中国果树

CSTPCD
影响因子:0.45
ISSN:1000-8047
年,卷(期):2024.(7)
  • 30