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基于ITS2序列的15种淫羊藿属药用植物分类鉴定研究

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为探讨内转录间隔区2(ITS 2)序列及其二级结构在15种淫羊藿属(Epimedium)中的鉴定效率.利用试剂盒提取叶片总DNA,对ITS 2序列进行PCR扩展与测序,计算K 2 P遗传距离,构建系统发育树,预测其二级结构.结果表明,ITS 2序列在15种淫羊藿属植物中的通用性好,扩增成功率与测序成功率均为100％.从K 2 P种间和种内遗传距离看,ITS 2在淫羊藿属中的种间变异较小,部分种类种内遗传距离大于种间遗传距离,鉴定成功率约为60％.采用比对法(Blast)分析,ITS 2鉴定效率为75％.由ITS 2系统进化树可知,淫羊藿属与鬼臼属各为一支,易于分开.除薄叶淫羊藿 、竹山淫羊藿 、巫山淫羊藿外,其余种类均能较好的进行聚类;除粗毛淫羊藿 、保靖淫羊藿外其余均不能与NCBI下载到的序列进行较好聚类.研究表明,15种淫羊藿属植物ITS 2序列在ML系统进化树中具较好的鉴别能力,但淫羊藿属各样本种内与种间遗传较为混乱,遗传距离复杂,ITS 2二级结构形态结构亦较为相似,将各种间进行区分存在一定难度,不适合单独作为该属条形码使用.
Taxonomic Identification Analysis of 15 Medicinal Plants of Epimedium based on ITS 2 Sequence

严福林、徐文芬、孙庆文、魏升华、何顺志

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贵州中医药大学药学院,贵阳 550025

淫羊藿属 ITS2 分类鉴定 DNA条形码

国家自然科学基金贵州省中药现代化项目国家中医药局项目贵州省教育厅项目贵州省教育厅项目

81160506黔科合社字 [2010]5050 号国中医药科技中药 2014 ～ 117号黔教合 KY 字[2017]179合同黔教合 KY 字[2017]018

2019

种子
贵州省种子管理站 贵州省种子学会 中国种子协会

种子

CSTPCD北大核心
影响因子：0.502
ISSN：1001-4705
年,卷(期)：2019.38(6)
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