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PEG胁迫下玉米转录组差异性分析

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为了明确玉米响应PEG胁迫的关键表达基因,比较PEG胁迫下玉米基因表达的差异,本实验利用RNA-seq对正常灌溉和干旱胁迫的玉米进行转录本测序和数据分析,共获得12358个差异表达基因,其中5275个基因为上调表达,7083个基因为下调表达.对差异表达基因进行COG功能分类,共得到23个不同的COG功能,其中翻译后修饰,蛋白质转换,伴随蛋白681个,占7.74%;信号传导机制功能有转录本675个,占7.67%;转录506个,占5.75%.KEGG通路显著富集到光合作用-天线蛋白、光合生物的固碳作用、卟啉和叶绿素代谢、脂肪酸降解、精氨酸和脯氨酸代谢、磷酸肌醇信号等生命代谢途径.
Difference Analysis of Maize Transcriptome under PEG Stress

赵志军、刘延波、李海登、王一菲、刘润雨、潘春梅、孙西玉

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河南牧业经济学院食品与生物工程学院(酒业学院),郑州 450046

河南牧业经济学院河南省白酒风格工程技术研究中心,郑州 450046

河南牧业经济学院郑州市白酒酿造微生物技术重点实验室,郑州 450046

张弓老酒酒业有限公司,河南 宁陵 476733

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RNA-seq 玉米 PEG胁迫 差异表达 代谢通路

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2020

种子
贵州省种子管理站 贵州省种子学会 中国种子协会

种子

CSTPCD北大核心
影响因子:0.502
ISSN:1001-4705
年,卷(期):2020.39(2)
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