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林烟草(Nicotiana sylvestris)K+通道蛋白基因NsAKT 1克隆及生物信息学分析

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AKT 1是一种重要的钾离子通道蛋白,负责植物体中K+的吸收和运输.为探讨烟草中AKT 1编码基因的序列结构和蛋白功能,以林烟草(N.sylvestris)为材料,以cDNA为模板对NsAKT 1基因进行同源克隆,同时对NsAKT 1编码蛋白的结构及功能进行预测.结果表明,NsAKT1基因的开放阅读框全长2682 bp,可编码893个AA,分子量为100.375 kDa.利用ProtParam、SignalP 4.0软件及Tmpred等软件对NsAKT 1蛋白的结构预测显示,该蛋白是一个亲水性的酸性跨膜蛋白,无信号肽,为非分泌型蛋白.NsAKT 1主要定位于内质网膜、高尔基体、质膜等部位,其二级结构由48个α螺旋(α-helix)、35个延伸链(extended strand)、36个β转角(β-turn)及59个无规则卷曲(random coil)组成,三者间通过无规则卷曲(random coil)进行连接.本研究为进一步探讨NsAKT 1的生物学功能提供了理论依据.
Cloning and Bioinformatics Analysis of the K+ Channel Protein Gene NsAKT 1 of Nicotiana sylvestris

韦春、宋小潘、秦利军

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贵州大学农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室/生命科学学院, 贵阳 550025

林烟草 NsAKT1 基因克隆 生物信息学

贵州省科技计划项目贵大人才培育项目

黔科合LH[2016]7449号黔科合平台人才[2018]5781号

2020

10.16590/j.cnki.1001-4705.2020.11.019

种子
贵州省种子管理站 贵州省种子学会 中国种子协会

种子

CSTPCD北大核心
影响因子：0.502
ISSN：1001-4705
年,卷(期)：2020.39(11)
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