基于F2∶3家系的玉米籽粒相关性状QTL定位与候选基因分析
QTL Mapping and Candidate Gene Analysis of Kernel Related Traits by Using Maize F2∶3 Family Lines
何玥 1聂蕾 1郭爽 1王栋 1涂亮 1刘鹏飞 2郭向阳 2王安贵 2祝云芳 2吴迅 3陈泽辉2
作者信息
- 1. 贵州大学农学院,贵阳 550025;贵州省农业科学院旱粮研究所,贵阳 550006
- 2. 贵州省农业科学院旱粮研究所,贵阳 550006
- 3. 贵州省农业科学院旱粮研究所,贵阳 550006;农业农村部喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室,贵阳 550006
- 折叠
摘要
本研究以热带玉米骨干自交系T32和QR273构建的F2∶3家系为材料,运用高通量GBS测序技术对其进行基因型鉴定,结合该群体在两个不同环境下的籽粒相关性状评价结果,利用完备区间作图法,共定位到52个控制玉米籽粒相关性状的QTL,其中粒长相关QTL 17个,粒宽相关QTL 24个,百粒重相关QTL 11个,可解释1.44％～14.48％的表型变异.其中3个主效QTL分别位于第1、2、10号染色体上,贡献率分别为14.48％、12.00％、10.21％.利用生物信息学分析,筛选出控制籽粒相关性状的候选基因3个,分别是Zm00001d02010、Zm00001d023914、Zm00001d020418,通过参与和调控植物体内各项生理活动和信号传导从而影响籽粒的大小.
Abstract
In this study,F2∶3 families constructed from tropical maize backbone inbred lines T32 and QR273 were identified by high-throughput GBS sequencing technology,and the results of grain-relat-ed traits evaluation in two different environments were combined.A total of 52 QTLs controlling grain related traits were identified by complete interval mapping,including 17 QTLs related to grain length,24 QTLs related to grain width,and 11 QTLs related to 100 grain weight,which could explain 1.44％-14.48％of phenotypic variation.Three major QTLs were located on chromosome 1,2 and 10,with contribution rates of 14.48％,12.00％and 10.21％,respectively.Three candidate genes controlling grain-related traits,Zm00001d02010,Zm00001d023914 and Zm00001d020418,were screened by bioinformatics analysis,which affected the grain size by participating in and regulating various physiological activities and signal transduction in plants.
关键词
玉米/籽粒相关性状/QTL/候选基因Key words
maize/kernel related traits/QTL/candidate genes引用本文复制引用
基金项目
贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2022]重点026)
贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2022]重点029)
贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2022]重点025)
国家自然科学基金(32171981)
国家自然科学基金(32060460)
国家自然科学基金(32160451)
黔农科院国基后补助项目([2021]16号)
黔农科院国基后补助项目([2021]55号)
黔农科院国基后补助项目([2022]02号)
黔农科院国基后补助项目([2022]09号)
贵州省玉米现代农业产业技术体系建设项目遗传育种功能实验室项目(GZCYTX2023-0102)
贵州省农科院科技创新项目([2022]03号)
贵州省育种科研基础平台创新能力建设项目(黔科合服企[2022]014)
贵州省自然科学基金(黔科合基础[2022]一般236)
十层次人才项目([2018]5629)
出版年
2024
国家科技期刊平台
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