转化医学电子杂志2019,Vol.8Issue(4) :232-236.

基于贝叶斯网络的典型关节炎代谢谱研究

A metabolic profiling study on typical arthritis based on Bayesian network

李忆涛 桑潮 梁丹丹 陈天璐
转化医学电子杂志2019,Vol.8Issue(4) :232-236.

基于贝叶斯网络的典型关节炎代谢谱研究

A metabolic profiling study on typical arthritis based on Bayesian network

李忆涛 1桑潮 1梁丹丹 1陈天璐1
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作者信息

  • 1. 200233 上海,上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心
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摘要

目的 比较类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者及痛风性关节炎(gout arthritis,GA)患者与正常对照组之间血清代谢谱的差异,构建两种关节炎共有和特有代谢物的贝叶斯网络模型.方法 采用液相色谱质谱和气相色谱质谱技术检测27例RA患者及34例GA患者和60例正常对照者血清代谢产物,识别RA及GA的潜在生物标志物;构建基于贪婪搜索算法的两种关节炎特有和共有代谢物的贝叶斯网络图.结果 RA及GA组与正常对照组血清代谢物存在明显差异,基于单元及多元统计方法,RA组筛选出34个差异代谢物,GA组筛选出41个差异代谢物,其中两种关节炎共有的差异代谢物14个;基于上述代谢物构建的贝叶斯网络揭示了不同代谢物之间可能存在的因果关系.结论 相比于代谢组学传统的多元统计学方法,贝叶斯网络能良好反映疾病差异代谢物之间存在的因果关系,在代谢组学中具有较好的应用前景.

关键词

类风湿性关节炎/痛风性关节炎/贝叶斯网络/贪婪搜索算法

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基金项目

国家自然科学基金(31501079)

国家自然科学基金(81772530)

国家自然科学基金(31500954)

出版年

2019
转化医学电子杂志

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ISSN:
参考文献量2
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