转化医学电子杂志2019,Vol.8Issue(4) :237-239,244.

用gap基因和MALDI-TOF MS技术对临床常见凝固酶阴性葡萄球菌快速分子鉴定

Rapid molecular identification of common coagulase negative staphylococcus species by gap gene sequencing and MALDI-TOF MS protein profiling

翟鑫 冯柏娥 张雪静 刘朝军
转化医学电子杂志2019,Vol.8Issue(4) :237-239,244.

用gap基因和MALDI-TOF MS技术对临床常见凝固酶阴性葡萄球菌快速分子鉴定

Rapid molecular identification of common coagulase negative staphylococcus species by gap gene sequencing and MALDI-TOF MS protein profiling

翟鑫 1冯柏娥 2张雪静 3刘朝军4
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作者信息

  • 1. 100048 北京,中国人民解放军总医院第六医学中心
  • 2. 100094 北京,解放军第984医院放射科
  • 3. 100036 北京,北京卫戍区第55离休所
  • 4. 100094 北京,解放军第984医院检验科
  • 折叠

摘要

目的 研究旨在通过对比gap基因和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)蛋白质质谱鉴定,建立对临床常见凝固酶阴性葡萄球菌(coagulase negative staphylococcus,CNS)的快速分子学鉴定.方法 用gap基因对临床常见CNS进行扩增和测序,获得序列在GenBank中进行比对,构建进化树进行同源分析,同时与MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定比较.结果 Gap基因相似率为39%~98%,有足够序列差异区分CNS.进化树同源分析显示,CNS分类具有较高的可信度(大于77%);MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定与gap基因鉴定符合率为100%.结论 MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定可以用于CNS的快速、准确鉴定,比传统方法和分子方法具有优势.

关键词

Gap基因/MALDI-TOF/MS/凝固酶阴性葡萄球菌/鉴定

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出版年

2019
转化医学电子杂志

转化医学电子杂志

ISSN:
被引量1
参考文献量2
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