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用gap基因和MALDI-TOF MS技术对临床常见凝固酶阴性葡萄球菌快速分子鉴定

Rapid molecular identification of common coagulase negative staphylococcus species by gap gene sequencing and MALDI-TOF MS protein profiling

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目的 研究旨在通过对比gap基因和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)蛋白质质谱鉴定,建立对临床常见凝固酶阴性葡萄球菌(coagulase negative staphylococcus,CNS)的快速分子学鉴定.方法 用gap基因对临床常见CNS进行扩增和测序,获得序列在GenBank中进行比对,构建进化树进行同源分析,同时与MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定比较.结果 Gap基因相似率为39％～98％,有足够序列差异区分CNS.进化树同源分析显示,CNS分类具有较高的可信度(大于77％);MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定与gap基因鉴定符合率为100％.结论 MALDI-TOF MS蛋白质质谱鉴定可以用于CNS的快速、准确鉴定,比传统方法和分子方法具有优势.

翟鑫、冯柏娥、张雪静、刘朝军

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100048 北京,中国人民解放军总医院第六医学中心

100094 北京,解放军第984医院放射科

100036 北京,北京卫戍区第55离休所

100094 北京,解放军第984医院检验科

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Gap基因 MALDI-TOF MS 凝固酶阴性葡萄球菌 鉴定

2019

转化医学电子杂志

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ISSN：
年,卷(期)：2019.8(4)
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