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杨梅全基因组测序结果初报

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杨梅(Myrica rubra Sieb.et Zucc.)是我国南方著名的特产珍果,为促进杨梅分子育种及功能基因研究,对杨梅进行了全基因组测序.采用Illumina Hiseq 2500双端测序策略,构建了200 bp文库,进行双端125 bp (PE125)测序,得到约13.70 Gb的原始数据.数据评估得知杨梅基因组大小约为304.38 Mb,重复序列含量约为45.82％,杂合率约为0.58％,基因组的GC含量约37.99％.利用SOAPdenovo软件进行了拼接组装.这一结果有助于开展杨梅后续的分子育种及基因功能研究.
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戚行江、任海英、梁森苗、郑锡良、吴阳春

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浙江省农业科学院园艺研究所,浙江杭州310021

杨梅 全基因组测序 基因组特征评估

国家公益性行业(农业)科研专项经费浙江省果品农业新品种选育重大科技专项浙江省农业科学院杨梅工程中心基金

2012030892012C12904-3

2015

10.16178/j.issn.0528-9017.20151011

浙江农业科学
浙江省农业科学院,浙江大学

浙江农业科学

影响因子：0.523
ISSN：0528-9017
年,卷(期)：2015.56(10)
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