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基于SSR标记的白蜡群体遗传多样性和群体结构分析

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[目的]白蜡是北方重要的盐碱地造林树种,了解白蜡居群的遗传多样性和群体结构对于白蜡种质资源的有效保护和开发利用至关重要.[方法]利用筛选的SSR标记,对来自 9 个不同地理区域的共 380 份白蜡种质资源进行遗传分化分析、分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析.[结果]12 对SSR引物在所有白蜡中都能进行扩增,等位基因(Na)共 51 个,平均每对引物观察到4.287个等位基因,PIC为0.119 7~0.750 9,平均为0.532 9,高于0.5;白蜡居群的群体内近交系数(Fis)平均为0.016,群体近交系数(Fit)平均为0.091,显示杂合频率高,居群近交较多,群体分化率(Fst)平均为0.095,存在中度程度的遗传分化,基因流(Nm)平均为 4.199,居群间基因交流非常丰富;AMOVA分析结果表明 9 个白蜡居群的遗传差异主要来源于个体间(91%);群体结构分析结果显示,9 个来自不同地理区域的白蜡居群中存在3个不同的基因库,居群间在进化上相对独立,存在一定程度的遗传混合,遗传组分相对单一,与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致.[结论]12 个SSR标记多态性较好、稳定性较高,能有效鉴别来自 9 个不同地理区域白蜡居群的 380 份种质资源,并揭示种质的遗传多样性和群体遗传结构,可为白蜡的种质保存和育种提供有价值的科学依据.
Analysis of the genetic diversity and population structure of Fraxinus spp.populations based on SSR markers

SSR markersFraxinus spp.genetic diversitypopulation structure

高铖铖、燕丽萍、吴德军、王因花

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山东省林业科学研究院 山东省林木遗传改良重点实验室,山东 济南 250014

SSR标记 白蜡 遗传多样性 群体结构

国家重点研发计划项目山东省自然科学基金泰山学者工程项目

2021YFD22003030109ZR2022MC090

2023

中南林业科技大学学报
中南林业科技大学

中南林业科技大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.442
ISSN:1673-923X
年,卷(期):2023.43(6)
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