首页|川渝大豆生育期性状的全基因组关联分析

川渝大豆生育期性状的全基因组关联分析

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
生育期是大豆品种适应生态环境进化的结果,对产量和农艺性状都有重要影响.解析南方,特别是挖掘川渝地区大豆生育期相关遗传位点并筛选出候选基因,能为该地区大豆育种奠定一定的理论基础.以川渝地区 227 份大豆品种或资源为试验材料,利用 135个SSR标记和 107,081个有效SNPs标记进行基因分型,分别考察及统计了 2016年安徽凤阳和四川自贡、2018 年安徽凤阳 3 个环境的营养生长期、生殖生长期、全生育期以及营养生长/生殖生长期比值.川渝大豆 4 个性状的表型分布整体呈正态分布,遗传变异受品种、环境和环境互作的显著影响.通过全基因关联分析,使用SSR标记共检测到 51 个与生育期性状显著关联的位点,使用SNP标记检测到 70 个与生育期性状显著关联的位点.其中在 2 个以上的环境下同时被检测的区域有:位于 13 号染色体 BLK_29175719-29275719 和BLK_30878620_30978620,14号染色体BLK_48763386_48863386以及16号染色体BLK_10093551_10293551区块,在这 4 个区域内预测到 11 个与植物生长发育有关的可能候选基因,同源基因预测表明 6 个与生育调控相关,进一步的单倍型分析表明有 3 个基因单倍型在生育期性状表型上存在显著差异,分别是 Glyma.13g177600、Glyma.13g178500和Glyma.13g195200.
Genome-wide association analysis of growth period traits in soybean of Sichuan and Chongqing

soybeangrowth periodSNPgenome-wide association analysis

杨豪、向仕华、刘丽、宁可君、杨雪、舒英杰、何庆元

展开 >

安徽科技学院,安徽凤阳 233100

自贡市农业科学研究院,四川自贡 643000

大豆 生育期 SNP 全基因组关联分析

安徽省重点研发项目国家自然科学基金国家自然科学基金四川省科技计划四川省科技计划重点研发项目四川豆类杂粮创新团队春大豆技术研究岗位项目安徽教育厅自然科学基金重点项目安徽科技学院项目

202104a0602002931871711321017042022SZYZF082021YFYZ0018SCCXTD-2020-20KJ2020A00662021zrzd13

2023

10.3724/SP.J.1006.2023.24210

作物学报
中国作物学会　中国农业科学院作物科学研究所

作物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.803
ISSN：0496-3490
年,卷(期)：2023.49(10)
  • 1
  • 3