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基于小RNA深度测序技术鉴定侵染我国部分省市草莓种苗的病毒种类

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随着草莓保护地栽培面积的增加和无性繁殖种苗的繁殖与调运,草莓病毒病的发生与流行日益严重.为明确侵染我国部分省市草莓种苗的病毒种类,应用小RNA深度测序技术进行检测,并利用RT-PCR技术对结果进行验证及序列分析.结果表明,从来自我国7省市的41株具有典型病毒病症状的草莓种苗样品中检测到草莓斑驳病毒 strawberry mottle virus(SMoV)、草莓镶脉病毒 strawberry vein banding virus(SVBV)和草莓轻型黄边病毒strawberry mild yellow edge virus(SMYEV)3 种.SMoV、SVBV 和 SMYEV 的检出率分别为 34.1％、24.4％和2.4％.选取不同产地草莓种苗上检出的不同病毒进行部分序列测定和分析,获得了 3个SMoV分离物(四川分离物schhy13、辽宁分离物lnhy23和河北分离物hbhy28)的部分RNA1 3'端非编码区606 bp核苷酸序列,其一致性为98.12％～99.34％.测定并获得了 5个SVBV分离物(辽宁分离物lnhy15、lnhy17、lnhy24、河北分离物hbhy28和陕西分离物shaxhy35)的ORF6的部分基因及其5'端非编码区的核苷酸序列,其中部分ORF6基因序列的一致性为97.98％～99.8％.仅1个辽宁样品中检测到SMYEV,获得了辽宁分离物lnhy26,其CP基因序列与中国甘肃分离物sy02的一致性为99.02％.病毒侵染草莓植株产生的典型症状有叶片畸形、变色和植株矮化.存在2种病毒和3种病毒复合侵染的情况,占所有阳性样品的41.2％.辽宁和河北的'红颜'种苗中检出SMoV和SVBV或SMoV、SVBV和SMYEV的复合侵染情况;四川和陕西的'红颜'种苗仅检出SMoV或SVBV,而其他省市和品种均未检出病毒.研究结果可以为草莓病毒的检测以及草莓病毒病的科学防治提供依据.
Identification of viruses infecting strawberry seedlings in some provinces of China by small RNA deep sequencing technology

王佳、白莹雪、祝宁、齐长红、任俊达、韩成贵、尚巧霞

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北京农学院,农业农村部华北都市农业重点实验室,北京 102206

北京市昌平区农业技术推广站,北京 102200

中国农业大学植物病理学系,农业生物技术国家重点实验室,北京 100193

草莓病毒病 小RNA深度测序技术 RT-PCR 病毒检测

北京市粮经作物产业创新团队项目

BAIC09-2021

2022

10.16688/j.zwbh.2021079

植物保护
中国植物保护学会 中国农业科学院植物保护研究所

植物保护

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.004
ISSN：0529-1542
年,卷(期)：2022.48(3)
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