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进境玉米种子中小麦花叶病毒的检测及其RNA3序列全长扩增分析

Detection of wheat mosaic virus in imported maize seeds and sequence analysis of its full-length genome of RNA3

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小麦花叶病毒(wheat mosaic virus,WMoV)是严重危害小麦、玉米等禾本科作物的种传病毒,在我国尚无发生,具有重要检疫意义.本研究利用引物WMoV-283F/R全国首次检测出玉米种子中的WMoV,成功扩增出了两个不同典型毒株NP序列,并分析其序列特征.根据WMoV-RNA3、WMoV-RNA3A和WMoV-RNA3B序列特点设计特异性引物,经RT-PCR扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA,扩增产物测序得到283 bp基因序列,分别与WMoV分离物GG1-RNA3B(GenBank登录号KT988872.1)、WMoV分离物K1-RNA 3(GenBank登录号KT988889.1)同源性为96.11％、96.47％.设计引物分别扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA核衣壳全长序列,得到WMoV-Germany RNA3、WMoV-Malaysia RNA3A和WMoV-Malaysia RNA3B全长序列.使用MEGA6软件采用Maximum likelihood法建立系统发育树,它们分别属于3个同源性差异明显的簇.通过DNAMAN序列比对分析三者的关系,RNA3序列在标尺碱基位点220～506区域序列差异性最大,而序列700～892、972～1102区段则相对保守.这为检测引物的设计提供了重要参考.WMoV的首次截获并鉴定为该病毒的检测鉴定和致病机理研究提供依据.

田沂民、俞禄珍、易建平、王书平、印丽萍、于翠

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上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 上海200135

小麦花叶病毒 进境玉米种子 RT-PCR检测 序列分析 系统发育树

上海市科技兴农项目

2019-02-08-00-08-F01150

2022

10.19662/j.cnki.issn1005-2755.2022.01.004

植物检疫
中国检验检疫科学研究院

植物检疫

CSTPCD
影响因子：0.498
ISSN：1005-2755
年,卷(期)：2022.36(1)
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