植物检疫2022,Vol.36Issue(3) :31-38.DOI:10.19662/j.cnki.issn1005-2755.2022.03.006

丁香疫霉菌RPA/CRISPR-Cas12a快速检测方法的建立

Development of rapid detection for Phytophthora syringae based on RPA/CRISPR-Cas12a

雷荣 孙夕雯 江丽 王振华 李国庆 李远 廖晓玲 吴品珊
植物检疫2022,Vol.36Issue(3) :31-38.DOI:10.19662/j.cnki.issn1005-2755.2022.03.006

丁香疫霉菌RPA/CRISPR-Cas12a快速检测方法的建立

Development of rapid detection for Phytophthora syringae based on RPA/CRISPR-Cas12a

雷荣 1孙夕雯 2江丽 1王振华 3李国庆 4李远 5廖晓玲 6吴品珊1
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作者信息

  • 1. 中国检验检疫科学研究院 北京 100176
  • 2. 沈阳农业大学土地与环境学院
  • 3. 武汉海关
  • 4. 华中农业大学
  • 5. 重庆医科大学永川附属医院
  • 6. 重庆理工大学
  • 折叠

摘要

丁香疫霉病菌(Phytophthora syringae,PS)造成数十种蔷薇科植物严重病害,是我国的植物检疫性有害生物.本研究根据GenBank中PS的Ras-like protein(Ypt1)基因,建立重组酶聚合酶等温扩增结合CRISPR-Cas12a系统的荧光法和侧向流层析试纸条快速检测方法,以实现在田间或口岸快速、准确、灵敏检测丁香疫霉病菌的目的.本研究优化了 RPA/CRISPR-Cas12a的反应条件,考察了特异性、灵敏度以及实际样品检测能力.结果表明,该方法37℃扩增40min,能特异性地检测丁香疫霉菌,灵敏度为133fg,与荧光定量PCR相当.本研究建立的快速检测方法可用于丁香疫霉菌的快速诊断.

关键词

丁香疫霉病菌/重组酶聚合酶扩增/CRISPR-Cas12a/快速检测

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基金项目

国家重点研发计划(2021YFC2600402)

中国检验检疫科学研究院基本科研业务费项目(2020JK048)

出版年

2022
植物检疫
中国检验检疫科学研究院

植物检疫

CSTPCD
影响因子:0.498
ISSN:1005-2755
被引量4
参考文献量6
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