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葡萄EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

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为开发高效实用的EST-SSR基因标记,从220547条葡萄EST序列中共搜索到20687条至少含有1个SSR位点的EST序列,占EST总数的9.3%.高频率重复类型为一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸,占EST-SSR总数的95.7%,其他重复类型仅占4.3%.其中最常见的是一核苷酸重复,其次是二核苷酸重复.从葡萄SSR分析表中筛选出25对EST-SSR引物并对52份葡萄材料进行PCR扩增,结果表明:25对EST-SSR引物在52个葡萄品种中共扩增出条带1033条,其中多态性条带为671条,多态率高达65%.采用NTSYS聚类分析法构建系统树,通过EST-SSR标记对供试品种的聚类分析结果与形态学、生物学分类结果基本一致,说明通过此方法获得的EST-SSR可以作为有效标记用于葡萄遗传多样性分析及遗传图谱构建等.
Development of the EST-SSRs marker and application on genetic diversity analysis from grapevine

毛娟、梁国平、卢世雄、马宗桓、王萍、陈佰鸿

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甘肃农业大学园艺学院,甘肃兰州 730070

葡萄 EST-SSR 遗传多样性

甘肃省葡萄酒产业发展专项甘肃省科技重大专项

18ZD2NA006

2019

中外葡萄与葡萄酒
中国酿酒工业协会 山东省酿酒葡萄科学研究所

中外葡萄与葡萄酒

影响因子:0.46
ISSN:1004-7360
年,卷(期):2019.(6)
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