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基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子

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桃(Prunus persica)是我国重要的果树树种之一,其果皮色泽是重要的外观品质.本研究以同期成熟的红色桃‘秋雪’和白里‘肥桃’为试材,基于Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台,采用RNA-seq技术比较分析两个品种桃果实不同发育时期转录组数据.测序共产生16.59 Gb Clean Data测序数据,基于有参或无参转录组序列组装法获得30 211个Unigene,其中3 060个差异表达基因在Nr、Swissprot、GO、COG和KEGG数据库中得到功能注释.在这些注释的差异基因当中有6个KEGG通路得到显著富集,其中包括类黄酮合成通路和光合通路.差异基因与植物转录因子数据库比对,筛选到153个差异表达基因分属于32个转录因子家族,其中包括已报道的参与调控花青苷合成的MYB和bHLH两类转录因子家族.进一步对花青苷代谢途径中的类黄酮合成通路中的关键酶基因进行q-PCR分析发现,CHS、CHI和F3H在‘肥桃’和‘秋雪’桃中表达方式很相似,但DFR、ANS和UFGT表达模式上存在较大差别,尤其是UFG倦因.通过果皮花青苷含量检测分析发现,‘秋雪’桃与‘肥桃’果皮中花青苷含量变化趋势与UFGT基因的表达模式一致.本研究结果有助于阐明桃不同果皮色泽分子遗传差异,为揭示其调控机制奠定基础.
Comparative analysis of anthocyanin expression patterns and transcription factors in different colored peach skins based on transcriptome data

何平、李林光、王海波、常源升

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山东省果树研究所,山东泰安271000

转录组 转录因子 果皮色泽 花青苷

现代农业产业技术体系现代农业产业技术体系山东省农业重大应用技术创新课题山东省农业科学院农业科技创新工程

CARS-30-Z-082014-38和CXGC2016B07

2019

植物生理学报
中国植物生理学会,中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所

植物生理学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.532
ISSN:2095-1108
年,卷(期):2019.55(3)
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