花序大小是评价绣球花观赏性的重要指标,通常用花序直径来衡量植物花序的大小.全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)能够识别与特定性状相关联的分子标记;利用这些分子标记可以进行分子标记辅助育种(molecular marker-assisted breeding,MAB),从而加快新品种的选育.本研究以125份绣球植株为材料,基于基因组重测序获得的SNP分子标记,利用混合线性模型(mixed linear model,MLM)进行全基因组关联分析,定位控制花序大小的关键基因.结果表明,通过GWAS分析检测到24个与花序大小相关的SNP位点[-1og10P≥5],表型贡献率在5.01％～23.48％之间;对定位的24个SNP位点进行基因注释,获得了74个候选基因,其中68个基因位于基因间隔区,6个位于基因编码区.在74个候选基因中57个具有基因功能注释,另外17个未能注释.根据注释结果,获得了6个与花序大小发育相关的基因,包括3个植物生长素响应基因(SAUR)、1个扩张蛋白基因、1个吲哚-3-乙酸诱导蛋白基因(ARG7)以及1个ABC转运蛋白基因.
Genome-wide association studies for inflorescence size in Hydrangea macrophylla
万方数据
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