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悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选

Preliminary Selection of Potential DNA Barcodes for Rubus

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为了建立悬钩子属(Rubus)植物的DNA条形码分子鉴定技术,筛选获得适用于悬钩子属植物的通用条形码序列.该研究基于GenBank数据对ITS、ITS2、matK、rbcL、trnH-psbA、trnL-trnF 6个DNA条形码序列进行了遗传变异、barcoding gap、建树等评估分析.结果 显示,trnH-psbA、matK、rbcL、rtnL-trnF的种内变异与种间变异差异较大,变异分辨率分别为97.32％、83.33％、79.07％、64.95％,存在较大的barcoding gap;NJ一致树分析显示,matK的单系性比例最高(67％),其次为trnH-psbA (64％),rtnL-trnF (43％),rbcL(30％).结果 表明,悬钩子属植物的matK与trnH-psbA序列种内变异与种间变异差异较大,能较好地区分不同物种,具有较大的鉴定潜力.建议将matK和trnH-psbA作为悬钩子属植物鉴定的核心条形码序列,rtnL-trnF、rbcL作为辅助条形码序列.

巫伟峰、沈玺龙、陈哲、杨鼎元、李永霞、王瑶、张群英

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贵州省植物园,贵阳550000

中国科学院庐山植物园,九江332900

悬钩子属 DNA条形码筛选 物种鉴定 matK trnH-psbA

贵州省科技厅黔科合成果项目

4330号

2020

植物研究
东北林业大学

植物研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.877
ISSN：1673-5102
年,卷(期)：2020.40(2)
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