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基于转录组测序的细风轮花青素合成途径及关键酶基因分析

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为进一步理解细风轮花青素合成途径,本研究利用华大基因BGISEQ-500平台对细风轮中的根、茎、叶、花4个组织进行了转录组测序,从头组装后得到128 856个Unigene.KEGG通路表明有40个Unigene编码了细风轮的花青素生物合成途径中6个关键酶.我们对其中的关键酶DFR(二氢黄酮醇还原酶)进行同源比对和空间结构模拟,结果显示DFR序列和结构均具有良好的保守性,且具有高度保守的NAD+结合位点,其二级结构主要由α螺旋和β折叠组成,在空间上α螺旋包裹着β折叠,形成“夹心饼干”样结构.
Identification of Key Enzyme Genes Involved in Anthocyanin Synthesis pathway in Clinopodium gracile by Transcriptome Analysis

赵历强、单春苗、张声祥、施圆圆、马克龙、吴家文

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安徽中医药大学研究生院,合肥230012

安徽中医药大学科研实验中心、新安医学教育部重点实验室,合肥230038

安徽中医药大学中西医结合学院,合肥230012

安徽道地中药材品质提升协同创新中心,合肥230012

安徽省中医药科学院,合肥230012

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细风轮 花青素 转录组 单基因 二氢黄酮醇还原酶

安徽高校自然科学研究重大项目名贵中药资源可持续利用能力建设项目国家自然科学基金国家级大学生创新训练项目

KJ2018ZD028206030281874431201810369050

2020

植物研究
东北林业大学

植物研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.877
ISSN:1673-5102
年,卷(期):2020.40(6)
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