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毛果杨GATA基因家族全基因组水平鉴定及表达分析

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GATA转录因子基因家族在植物生长发育、细胞分化以及响应环境变化中具有重要作用.然而,目前在木本植物中尚无该基因家族全基因组水平的分析报导.本项研究从基因组水平对毛果杨GATA家族成员的数量、基因结构、染色体定位、系统进化、编码蛋白的理化特征和保守基序等信息进行了系统分析,结果表明,毛果杨GATA家族包含39个基因,共分布于15条染色体上,其中5号染色体上含有6个基因,9号、13号和19号染色体含有基因数量为1,其余染色上无基因分布.该家族各基因的结构与编码蛋白的基本特性均存在一定异性,可分成4个亚族.qRT-PCR研究表明,GATA家族各基因在不同发育阶段的茎部表达量存在明显差异,且盐胁迫对各基因的表达特性影响显著.以上结果表明,毛果杨GATA家族基因在复制后,基因的结构与功能产生了明显分化,其中部分基因在毛果杨次生生长与盐胁迫响应中可能具有重要作用.本项研究为全面解析毛果杨GATA家族各成员在其生长发育与盐胁迫响应中的生物学功能奠定了基础.
Genome-wide Identification and Expression Analysis GATA Family of Populus trichocarpa

任梦轩、张洋、王爽、王瑞琪、刘聪、魏志刚

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林木遗传育种国家重点实验室,东北林业大学,哈尔滨150040

国家林业与草原局盐碱地研究中心,中国林业科学研究院,北京100091

毛果杨 GATA基因 盐胁迫 表达模式

国家自然科学基金

31770640

2021

10.7525/j.issn.1673-5102.2021.01.014

植物研究
东北林业大学

植物研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.877
ISSN：1673-5102
年,卷(期)：2021.41(1)
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