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黄独微型块茎鲨烯合酶的基因克隆与序列分析

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通过黄独微型块茎转录组数据库筛选到SQS基因的核心片段,利用RT-PCR技术获得SQS基因保守片段,采用RACE技术获得SQS基因的3′及5′末端序列,并采用生物信息学方法进行序列分析.结果表明,黄独微型块茎SQS基因编码序列长1548 bp,编码415 bp的氨基酸序列,理论分子量为46786.38 D,等电点(pI)为5.97.SQS蛋白为疏水性蛋白,无信号肽,含有SQS所必需的功能结构域,属于Isoprenoid_Biosym_C1 superfami-ly.黄独SQS蛋白与其他植物的SQS蛋白同源性较高,其中与盾叶薯蓣的SQS蛋白氨基酸相似性为96.4％.本试验结果从黄独微型块茎中首次获得SQS基因cDNA全长序列,该基因具有SQS同源基因的典型特征,为进一步研究黄独微型块茎SQS基因结构、基因表达和基因突变提供了基础,并为薯蓣属植物三萜合成通路关键酶SQS的正选择位点与功能的关联性分析提供了数据支持.
Cloning and Sequence Analysis of Squalene Synthase(SQS) Gene from Dioscorea bulbifera L. Microtuber

柯维忠、钟雯娟、刘凯盈、李祥媛、尹明华

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上饶师范学院生命科学学院,上饶 334001

黄独 微型块茎 鲨烯合酶 基因克隆 序列分析

GJJ19087731360072

2021

10.7525/j.issn.1673-5102.2021.02.012

植物研究
东北林业大学

植物研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.877
ISSN：1673-5102
年,卷(期)：2021.41(2)
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