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泡桐维管形成层及木质部区的转录组分析

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采用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术,获得泡桐维管形成层及木质部区组织转录组的109021918条clean reads(16.35 Gb).将clean reads从头组装得到104432个单基因簇(Unigene),平均长度662 nt.将组装得到的Unigenes与公共数据库进行序列比对,分别有40789(Nr:39.05％)、31675(NT:30.33％)、15539(COG:14.87％)、29168(GO:27.93％)、16316(KEGG:15.62％)、30499(SwissProt:29.20％)以及28828(Pfam:27.6％)个Unigenes获得功能注释.通过与GO数据库的比对分析,注释的29168个Unigenes归于生物过程、细胞组分及分子功能三大类的55个功能组;15539条Unigenes注释到COG数据库,被分为25个类别中;基于KEGG数据库可将16316个Unigenes归于130个代谢途径.此外,在泡桐的维管形成层及木质部区转录组中共检测出16118个简单序列重复(SSR)位点.为进一步挖掘泡桐重要功能基因提供了大量数据.
Transcriptome Analysis in Vascular Cambium and Xylem of Paulownia tomentosa

滕云、邱宗波、王稳利、张雪如

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信阳农林学院园艺学院,信阳 464000

河南师范大学生命科学学院,新乡 453007

泡桐 维管形成层 高通量测序 转录组

国家自然科学基金河南省高校科技创新人才项目

3150049916HASTIT019

2021

10.7525/j.issn.1673-5102.2021.03.005

植物研究
东北林业大学

植物研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.877
ISSN：1673-5102
年,卷(期)：2021.41(3)
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