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基于RNA-Seq技术的湿加松特定时期产脂差异基因筛选及表达分析

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湿加松(Pinus elliottii×P.caribaea)是我国南方重要的脂材兼用树种,为挖掘调控湿加松松脂产量的相关基因,在湿加松的产脂高峰期,选取生长量相近但产脂量显著差异的湿加松植株,采集次生木质部组织进行高通量测序,并结合萜类物质合成、转运通路进行分析.结果显示,测序共产生594108382条clean reads,经de novo拼接获得190514条unigenes,有304个unigene与萜类物质的合成有关.经过差异表达分析,得到414个差异表达unigenes,其中183个上调表达,231个下调表达.利用qRT-PCR技术对筛选的基因进行表达量验证分析,发现细胞色素P450、ABC转运蛋白、双功能松脂醇落叶松醇还原酶(PLR)在高脂树中表达量升高,异戊烯基转移酶表达量在低脂树中表达量较高.本研究丰富了湿加松及松科植物的转录本信息,为进一步研究湿加松松脂产量差异的分子机理奠定了重要基础.
Screening and Expression Analysis of Different Genes for Oleoresin Production in the Specific Period of Pinus elliottii×P.caribaea by RNA-Seq Technology

周晨晨、李义良、王哲、赵奋成、钟岁英、林昌明、谭志强、李福明、吴惠姗、郭文冰、廖仿炎、王建革

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广东省森林培育与保护利用重点实验室,广州 510520

广东省林业科学研究院,广州 510520

广东省台山市红岭种子园,台山 529200

江西农业大学园林与艺术学院,南昌 330045

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湿加松 转录组测序 产脂基因 qRT-PCR

广东省省级科技计划项目广东省林业科技创新专项资金项目

2017B0202320012018KJCX017

2021

植物研究
东北林业大学

植物研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.877
ISSN:1673-5102
年,卷(期):2021.41(3)
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