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基于GBS简化基因组技术的宽杯杜鹃遗传多样性分析

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宽杯杜鹃花色纯黄且钟状花冠簇生于枝顶,具有较高的观赏价值.近年来受道路建设及盗挖盗伐等人为影响,其生境破碎化严重且种群规模日渐萎缩,对其开展保护生物学研究已迫在眉睫.本研究采用基因分型(genotyping-by-sequencing,GBS)技术对宽杯杜鹃老君山(LJS)与大黑山(DHS)两个残存种群进行单核苷酸多态性(single-nucleotide-polymorphism,SNP)位点挖掘与遗传多样性分析.结果表明,通过获得的103133个高质量SNP位点分析发现两个种群在物种水平上具有较低的遗传多样性(Ne=1.3086,Ho=0.1878,He=0.1856),而种群间具有较高的遗传分化(Fst=0.1765),种群间基因流(Nm)=1.1674.聚类分析、主成分分析与种群遗传结构分析表明36个个体被聚为2个不同的遗传类群.本研究首次揭示了宽杯杜鹃较低的遗传多样性现状,有助于进一步了解其濒危机理和科学地制定宽杯杜鹃保护措施.
Genetic Diversity Assessment of Rhododendron sinofalconeri with Genotyping by Sequencing(GBS)

张序、张秀姣、马永鹏、李正红、万友名、马宏

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中国林业科学研究院资源昆虫研究所,昆明 650233

南京林业大学林学院,南京 210037

中国科学院昆明植物研究所,云南省极小种群野生植物综合保护重点实验室,昆明 650201

宽杯杜鹃 GBS SNP 遗传结构 回归引种

中国林科院基本科研业务费专项%%云南省"万人计划"青年拔尖人才计划项目"云南省技术创新人才"培养对象项目

CAFYBB2019ZB0072019HJ209600100620192016HB007

2021

10.7525/j.issn.1673-5102.2021.03.013

植物研究
东北林业大学

植物研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.877
ISSN：1673-5102
年,卷(期)：2021.41(3)
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