摘要
目的:探索结直肠腺癌lncRNA表达改变,寻找可作为结直肠腺癌预后指标的lncRNA;方法:结直肠腺癌3组DNA芯片数据,原始数据经过归一化后,进行差异基因表达筛选,根据注释文件获得差异表达基因和lncRNA.利用TCGA的测序数据和临床信息对所获得到的lncRNA进行分析.结果:共收集结直肠腺癌590例,正常样本67例,共有716个基因(含4个lncRNA)在结直肠腺癌中表达升高,928个基因(含10个lncRNA)表达下降.生存分析结果表明,在结直肠腺癌中高表达BBOX1-AS1和LINC01296与患者的总体生存率相关.
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