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结直肠腺癌预后相关的长链非编码RNA的筛选

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目的:探索结直肠腺癌lncRNA表达改变,寻找可作为结直肠腺癌预后指标的lncRNA;方法:结直肠腺癌3组DNA芯片数据,原始数据经过归一化后,进行差异基因表达筛选,根据注释文件获得差异表达基因和lncRNA。利用TCGA的测序数据和临床信息对所获得到的lncRNA进行分析。结果:共收集结直肠腺癌590例,正常样本67例,共有716个基因(含4个lncRNA)在结直肠腺癌中表达升高,928个基因(含10个lncRNA)表达下降。生存分析结果表明,在结直肠腺癌中高表达BBOX1-AS1和LINC01296与患者的总体生存率相关。

宦烨、蔡宏伟

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中南大学湘雅医院麻醉科 湖南长沙 410008

结直肠腺癌 GEO lncRNA 生物信息学分析

2018

中外医药研究

中外医药研究

ISSN:
年,卷(期):2018.1(27)
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