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西洋参根腐病抗性相关基因PqDELLA1的克隆及表达分析

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目的:克隆西洋参PqDELLA1基因,进行生物信息学分析,并探讨其在西洋参抗根腐病中的表达模式.方法:根据已获得的西洋参转录组数据,设计PqDELLA1基因全长扩增引物,利用无缝克隆的方法获得全长互补脱氧核糖核酸(cDNA);采用国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)在线Blastp、DNAMAN和MEGA 6.0等软件对序列进行生物信息学分析;通过实时荧光定量多聚核苷酸链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)检测PqDELLA1基因的组织表达及诱导表达模式.结果:扩增得到西洋参PqDELLA1基因,其cDNA序列为1743 bp,编码580个氨基酸;PqDELLA1蛋白相对分子质量为63910,理论等电点为5.01,不含信号肽,为非跨膜蛋白,定位于细胞核,与番茄SlDELLA蛋白氨基酸相似度最高.qPCR结果显示PqDELLA1基因在叶中表达量最高,其次为茎,根中最少;该基因的表达受根腐病病原菌茄病镰刀菌(Fusarium solani)的诱导,接种后5 d内持续升高后降低.结论:首次克隆出西洋参PqDELLA1基因并进行了生物信息学和表达特性分析,发现该基因可响应F.solani的侵染,为后续解析其参与西洋参抗病反应的分子机制提供参考.
Cloning and Expression Analysis of PqDELLA1 Gene in Root Rot Resistance of Panax quinquefolius L.

杨姗姗、王仪、刘紫祺、邵慧慧、高微微

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中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所,北京 100193

西洋参 根腐病 PqDELLA1 生物信息学 表达分析

中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目山东省重点研发计划重大科技创新工程项目

2016-I2M-1-0122019JZZY020905

2022

中国现代中药
中国中药协会,中国医药集团总公司,中国药材公司

中国现代中药

CSTPCD
影响因子:0.65
ISSN:1673-4890
年,卷(期):2022.24(5)
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