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不同种源银柴胡及其伪品的ITS2序列分析与鉴别

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目的:采用基于内转录间隔区2(ITS2)序列的分子鉴定法分别对17份不同种源银柴胡和6种伪品基原植物进行分析和鉴别.方法:对植物样品进行DNA提取、扩增、测序,并检索GenBank数据库,获取17份不同种源银柴胡及6种伪品的ITS2序列.采用ITS2数据库进行注释,去除5.8S和28S片段,获得完整的ITS2序列,利用MEGA 8.0软件进行序列比对、计算K2P遗传距离、构建邻接(NJ)系统发育树,采用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库和"中药材DNA条形码鉴定系统"进行BLAST分析和物种鉴定,并利用ITS2数据库预测二级结构.结果:17份银柴胡样品共得到3个单倍型ITS2序列(YCH1、YCH2和YCH3),经与银柴胡标准ITS2序列比对,发现YCH1和YCH2与标准序列一致,但YCH3有4处碱基缺失,表现出0.936的遗传距离,在系统发育树中被单独聚为一个分支,并具有不同的二级结构;6种伪品的ITS2序列在长度、鸟嘌呤+胞嘧啶占比、变异位点、遗传距离、NJ系统发育树和二级结构上均与银柴胡ITS2序列表现出明显的差异.结论:基于ITS2序列的分子鉴定方法可以有效鉴别银柴胡真伪,不同种源银柴胡的遗传物质可能存在一定差异.
Identification of Stellariae Radix and Its Counterfeits from Different Provenances Based on ITS2 Sequences

李振凯、冯璐、杨燕、宋乐、王红、李彦青、高跳、彭励

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宁夏大学 生命科学学院,宁夏 银川 750021

银柴胡 内转录间隔区2 DNA条形码 种质资源 真伪鉴别

宁夏回族自治区自然科学基金吴忠市科技创新驱动计划吴忠市同心县科技发展计划

2021AAC03103

2022

10.13313/j.issn.1673?4890.20220411004

中国现代中药
中国中药协会,中国医药集团总公司,中国药材公司

中国现代中药

CSTPCD
影响因子：0.65
ISSN：1673-4890
年,卷(期)：2022.24(12)
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