水稻品种TN1叶绿体基因组密码子偏好性分析

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中文摘要：水稻是我国主要粮食作物之一,叶绿体发育对其生长和产量至关重要.TN1水稻品种的叶绿体基因组分析表明,密码子偏好受到自然选择和碱基突变压力的影响.低GC含量和低ENC值表明基因具有强烈的密码子偏性,且基因表达水平与基因密码子第一位碱基的GC含量密切相关.中性绘图和PR2-plot结果显示自然选择对密码子偏好性的影响,而ENC-plot分析表明突变压力也对密码子偏性有一定影响.此外,最优密码子分析表明叶绿体基因组的密码子偏好以A和U结尾.研究结果为水稻叶绿体基因组密码子使用模式提供了科学依据,对于水稻品种的遗传改良和生产具有重要意义.

作者：

杨敏苒、齐慧龙、王田梦、王希胤

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作者单位：

华北理工大学生命科学学院,河北唐山 063210

华北理工大学基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山 063210

关键词：

水稻品种TN1 叶绿体基因组密码子偏好性最优密码子

出版年：

2024

DOI：

10.19904/j.cnki.cn14-1160/s.2024.20.002

种子科技

山西省种子协会,中国种子协会

种子科技

影响因子：0.161

ISSN：1005-2690

年,卷(期)：2024.42(20)