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大白菜雌性不育突变体fsm的转录组分析

omparative transcriptome analysis of a female-sterile mutant (fsm) in Chinese cabbage (Brassica campestris ssp. pekinensis)

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雌性不育突变体fsm的表现特征是雌蕊败育,但是雄蕊正常可育,其它花器官表型也发生了较大变异。遗传分析结果表明,该突变性状由一对隐性核基因控制。与野生型 'FT'相比,突变体fsm的胚珠发育异常。利用RNA-Seq技术,对野生型'FT'和突变体fsm的花蕾进行比较转录组分析,共检测到1,872个差异表达基因。经GO和KEGG pathway分析,筛选到一些参与胚珠发育的差异表达基因,包括PRETTY FEW SEEDS 2(PFS2)和温度诱导的脂质运载蛋白(temperature-induced lipocalin; TIL),同时鉴定出多个与花发育和开花相关的基因。利用qRT-PCR技术,分析了其中的18个差异表达基因的表达模式,包括2个与胚珠发育相关的基因和16个与花发育和开花相关的基因,推测突变基因fsm可能影响了胚珠的发育,使之不能完成正常的受精过程。

Vegetable scienceChinese cabbageFemale sterilityTranscriptome analysisRNA-Sequencing

姚润鹏、黄胜楠、侯莉、刘志勇、李承彧、李丹杨、李想、冯辉

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蔬菜学 大白菜 雌性不育 转录组分析 RNA-Seq

首发时间:2016-05-23