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基于生物信息学的miR-1靶基因预测和分析

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目的:采用生物信息学的方法对miR-1的靶基因进行预测,并对其集合进行富集分析和生物学描述。方法:分别采取TargetScan和PicTar对miR-1靶基因进行预测,取它们预测结果的合集。采用Cytospace的插件BiNGO和DAVID数据库,获得基因集合的基因本体注释和生物学通路信息并进行富集分析。结果:获得miRNA-1预测的靶基因229个;分子功能富集在生物分子结合、酶调节和催化活动等;生物学过程富集在生物组装、代谢调控、应对刺激、生物合成和代谢等。生物学通路富集在富集于剪接体、囊泡运输中SNARE相互作用和小细胞肺癌。结论:在高通量系统验证方法尚未建立的阶段,采用了生物信息学的方法,可以从miR-1调控网络中提出了进一步研究的线索。
he Bioinformatics Analysis of Predicted miRNA-1 Targets Genes

BioinformaticsmiRNA-1Targets Genes

陈胜喜、高阳、张春芳、罗万俊

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生物科学(分子生物学)

生物科学(生物科学研究方法、生物科学研究技术)

生物信息学 miR-1 靶基因

首发时间:2014-03-19