本研究针对转基因小麦检测技术的国家重大需求，重点发展了基于核酸、蛋白质及代谢物的转基因小麦高通量综合检测技术。研究使用抗病、抗逆、品质改良等性状的国内外主要转基因小麦材料，发展建立了一些基于核酸及转录组、蛋白质组及代谢组的转基因小麦快速高通量甄别检测新技术。 完成了3个内标准基因引物，建立了2个转基因小麦品系特异性鉴定技术，获得了与转基因相关的转录谱特征。同时获得了蛋白质差异图谱，利用质谱技术鉴定了差异蛋白质及其功能分析。建成了小麦组织代谢组原位检测分析技术、基于HPLC-DAD-NMR-MS联用的代谢物结构快速鉴定技术、基于代谢组NMR和LC-NMR-MS分析的转基因小麦检测技术，建立了植物代谢组的初步数据库。建成了抗病、抗逆和品质改良等性状的转基因小麦代谢组结构图库。
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