期刊,南方农业学报 2022年卷1期_国家学术搜索

期刊信息/Journal information

南方农业学报

广西壮族自治区农业科学院

主办单位：广西壮族自治区农业科学院

主　　编：李杨瑞

出版周期：月刊

国际刊号：2095-1191

电子邮箱：nfnyxb@163.com

电　　话：0771-3243905、3244920

邮政编码：530007

地　　址：广西南宁市大学东路174号

南方农业学报/Journal Journal of Southern AgricultureCSCD北大核心CSTPCD

查看更多>>本刊是由广西农业科学院主办的综合性农业科技期刊，主要报道农业科研新成果、新技术、新方法，农业生产新经验、新产业等。

正式出版

收录年代

瓜螺线粒体全基因组密码子偏好性分析

何积翠喻达辉白丽蓉

191-199页

查看更多>>摘要：[目的]探究瓜螺(Melo melo)线粒体全基因组密码子使用偏好性,明确影响密码子偏好性的因素,为提高基因表达效率及了解瓜螺线粒体基因组的特性和进化方向提供科学依据.[方法]以瓜螺线粒体全基因组序列为研究对象,从中筛选出11条长度大于300 bp且以ATG为起始密码子的非重复基因序列,利用CodonW 1.4.2、Excel 2017及SPSS 22.0等软件进行瓜螺线粒体全基因组密码子偏好性分析.[结果]不同基因序列密码子位置所对应的G+C含量不同,其中,GC1(密码子第1位所代表的G+C含量)、GC2(密码子第2位所代表的G+C含量)、GC3(密码子第3位所代表的G+C含量)的变化范围分别为35.20％～51.90％、16.40％～40.60％和13.10％～34.90％,对应平均值为41.15％、32.29％和23.71％,GC1和GC2明显高于GC3;密码子适应指数(CAI)在0.110～0.180,平均为0.137;密码子偏好性指数(CBI)在-0.272～-0.090,平均为-0.175;最优密码子使用频率(FOP)在0.216～0.339,平均为0.277;有效密码子数(ENC)在36.84～53.75,平均为45.59;总平均亲水性(GRAVY)在0.480～1.394,平均为0.968.有30个同义密码子的相对使用度(RSCU)大于1.00,且主要以A/U结尾.中性绘图分析发现,GC1和GC2平均值(GC12)与GC3的相关系数为-0.438,相关性不显著(P>0.05,下同);ENC-plot绘图分析结果显示,各散点(基因)均位于标准曲线附近,其中,NAD4、COX2和NAD3基因位于标准曲线上方,COX1、ATP6、NAD1、NAD6、COB、NAD5、COX3及NAD2等8个基因位于标准曲线下方;在对应性分析中,第一、第二、第三、第四向量轴的贡献率分别23.12％、15.19％、13.17％和9.63％,前4轴累计差异为61.12％.综合高频密码子与高表达密码子,最终筛选出4个最优密码子(UUU、GUU、ACU和CAU),且均以U结尾.[结论]瓜螺线粒体全基因组密码子偏好以A/U结尾的形式,筛选出的4个最优密码子(UUU、GUU、ACU和CAU)均以U结尾.除了自然选择在瓜螺线粒体全基因组密码子偏好性形成中占主导地位外,突变压力和碱基组成也影响其密码子偏好.因此,可通过瓜螺目的基因密码子优化,有效提高外源基因表达且优化性状决定基因,从而加速瓜螺优良亲本培育的进程.

关键词：

瓜螺线粒体基因组密码子偏好性自然选择

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阿朴酯颗粒剂对小鼠肝肾组织毒性、血清炎性因子及体液免疫水平的影响

王剑廖书丹杨剑文正常...

200-209页

查看更多>>摘要：[目的]观察长期添加阿朴酯颗粒剂对昆明小鼠肝脏、肾脏组织结构与功能及其体液免疫水平的影响,系统评价其安全性,为阿朴酯在畜禽生产中的科学应用提供参考依据.[方法]通过急性毒性试验测定阿朴酯颗粒剂对昆明小鼠的半数致死量(LD50),然后设50％LD50(1.4 g/kg)和80％LD50(2.2 g/kg)作剂量组,以等量生理盐水为空白对照.单次灌胃1.4 g/kg阿朴酯悬浊液后,于灌胃后第4、12、36和60 h及第7和14 d进行眼球采血,用于测定血常规指标;按1.4和2.2 g/kg的剂量分别连续灌胃阿朴酯悬浊液21 d后,分析小鼠体重增重、血清生化指标、尿常规指标及免疫指标的变化情况,并采集小鼠肝脏和肾脏制作石蜡切片进行组织学观察.[结果]阿朴酯颗粒剂对昆明小鼠的LD50为2.74 g/kg,95％置信限为2.69～3.41 g/kg.依据WHO毒性分级标准,阿朴酯颗粒剂属低毒级物质.按1.4 g/kg的剂量单次灌胃阿朴酯悬浊液后,昆明小鼠血液中性粒细胞数量在灌胃后第4 h显著升高(P<0.05,下同),白细胞总数在灌胃后第12和36 h显著升高,淋巴细胞数量在灌胃后第4和12 h极显著升高(P<0.01,下同),红细胞总数和平均红细胞血红蛋白含量在灌胃后第36 h显著升高.以2.2 g/kg的剂量连续灌胃阿朴酯悬浊液21 d后,昆明小鼠的体重增重和平均日增重极显著降低,血清中的碱性磷酸酶活性和尿素含量极显著升高、而谷草转移酶活性和肌酐含量极显著降低;尿液中白细胞数量及蛋白、微白蛋白和酮体含量显著上升;肝脏黄染、淤血,肝索与肝窦紊乱不清,肝细胞碎裂溶解,发生肿胀或坏死;肾脏明显肿大、黄染,肾小体破损消亡,髓质部呈弥漫性出血;血清免疫细胞因子IL-1β、TNF-α和IL-10水平显著或极显著升高,而免疫球蛋白IgM和SIgA浓度显著下降.[结论]阿朴酯颗粒剂属低毒级物质,但高剂量使用可快速升高血细胞数量,破坏小鼠肝肾组织结构并引起功能障碍,且对体液免疫有抑制作用.因此,建议在家禽生产中不可超量或长期添加,尤其拌料时需保证均匀,避免误食高剂量阿朴酯而造成肝肾功能损伤.

关键词：

阿朴酯颗粒剂小鼠肝肾毒性血清炎性因子体液免疫

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鸡卵泡膜细胞中膜联蛋白A2互作细胞蛋白的筛选及其功能分析

高洪波王燕碧张福平赵采芹...

210-218页

查看更多>>摘要：[目的]从鸡卵泡膜细胞蛋白中筛选和鉴定与膜联蛋白A2(ANXA2)相互作用的细胞蛋白并进行功能分析,为深入研究ANXA2调控鸡卵泡发育的作用机制提供理论依据.[方法]制备开产后30周龄贵州黄鸡的卵泡膜细胞,提取卵泡膜总蛋白后利用His Pull-Down联合质谱技术(LC-MS/MS)从卵泡膜细胞中筛选出与鸡ANXA2互作的细胞蛋白,然后通过GO数据库和KEEG数据库分别进行GO功能富集分析及KEEG信号通路注释分析,并利用STRING Version 11.0绘制蛋白互作网络图.[结果]通过His Pull-Down联合LC-MS/MS共鉴定获得41个鸡ANXA2互作细胞蛋白,GO功能富集分析发现这些互作细胞蛋白在分子功能、生物学进程和细胞组成均发挥作用.其中,在分子功能方面主要涉及蛋白结合(占58.06％)、催化活性(占19.35％)、核糖体结构(占16.13％)及细胞骨架结构组成(占6.45％),在生物学进程方面主要参与细胞骨架(占19.35％)、刺激反应(占19.35％)、翻译(占16.13％)、代谢过程(占12.90％)、细胞迁移(占12.90％)、蛋白折叠(占9.68％)和蛋白运输(占9.68％),而细胞组分显示以定位于细胞膜的蛋白为主(占32.26％).鸡ANXA2蛋白互作细胞蛋白参与的KEEG信号通路主要有应激反应、代谢、翻译、信号转导、免疫系统和蛋白定位等.鸡ANXA2互作细胞蛋白互作网络可分为3条,即CNN2-FN1-MYH9-MYH10-ACTN1-CSRP1、ANXA1-ANXA2-ENO1-PRDX4-GPI-ATP5B-PRDX3-HSPA8-TUBB2A和CCT7-CCT4-GNB2L1-ATP5A1-RPS3-RPS3A-RPL23A-RPL22-RPS7;互作细胞蛋白间存在复杂的互作关系,其中又以膜联蛋白A1(ANXA1)与烯醇化酶-1(ENO1)及ANXA2的互作关系最明显.[结论]鸡ANXA2互作细胞蛋白主要参与细胞骨架形成、应对刺激和翻译等生物学过程,涉及应激反应、代谢、翻译、信号转导、免疫及蛋白定位等信号通路.其中,PRDX3、PRDX4、MYH9和TC-SC可能通过与ANXA2蛋白相互作用而参与鸡卵巢相关疾病的发生,而ANXA1与ANXA2相互作用可能在鸡卵泡的发育及排卵过程中发挥重要调节作用.

关键词：

鸡卵泡膜细胞膜联蛋白A2(ANXA2)互作细胞蛋白卵泡发育

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基于环境DNA的进口凡纳滨对虾携带水传播虾肝肠胞虫风险评估

张娜刘荭廖金湾郑晓聪...

219-228页

查看更多>>摘要：[目的]基于环境DNA(eDNA)分析进口凡纳滨对虾携带水传播和运输虾肝肠胞虫(EHP)的风险性,为环境水中疫病监测和风险评估提供参考依据.[方法]取60批进口亲虾携带水用0.45μm硝酸纤维素膜过滤并提取eDNA,挑取10个携带水样滤膜eDNA用于凡纳滨对虾物种特异性鉴定,采用实时荧光定量PCR对所有携带水样滤膜进行EHP检测;同时以EHP阳性进口亲虾携带水开展人工感染试验,感染10 d后分别取养殖水样及虾体进行EHP检测;对进口亲虾携带水EHP阳性滤膜进行宏基因组测序分析,采用Krona对物种注释结果进行可视化展示,并将宏基因组测序分析结果与NCBI已公布的EHP氨基酸序列进行BLAST比对分析.[结果]进口亲虾携带水检测结果显示,成功从10个携带水滤膜eDNA扩增出凡纳滨对虾347 bp的特异目的片段,与原始序列片段的相似性达100％;在60批进口亲虾携带水样品中有2批携带水呈EHP阳性.EHP阳性进口亲虾携带水能成功感染虾苗组,且在虾苗肝胰腺组织分离获得成熟的EHP孢子,但亲虾组的虾体EHP检测呈阴性.宏基因组测序得到EHP的物种相对丰度值占真核动物物种的0.7％;与NCBI已公布的EHP氨基酸序列进行BLAST比对,结果获得213个同源EHP氨基酸序列;从进口亲虾携带水样品中分离鉴定获得的EHP与已报道物种黄道蟹肠孢虫(Enterospora canceri)和毕氏肠胞虫(Enterocytozoon bi-eneusi)的亲缘关系较近,对应的氨基酸序列相似性为别为83％和81％.[结论]进口凡纳滨对虾亲虾携带水具有传播EHP的可能性,即仅针对亲虾虾体进行EHP检测具有不完全性.eDNA检测可用来补充传统的虾体疫病监测方法,作为水环境疫病检测和风险评估的重要手段.

关键词：

凡纳滨对虾亲虾携带水虾肝肠胞虫(EHP)环境DNA(eDNA)风险评估

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斑马鱼g型溶菌酶基因序列分析及其原核表达

陈华林晨韬陈曦葛均青...

229-237页

查看更多>>摘要：[目的]实现斑马鱼g型溶菌酶在大肠杆菌中表达,以获得高纯度且具溶菌活性的融合蛋白,为探究g型溶菌酶在斑马鱼抗菌过程中的作用机制及其开发利用打下基础.[方法]通过ClustalW、ExPASy、SignalP-5.0 Server及PSIPRED等在线软件对斑马鱼g型溶菌酶进行生物信息分析,经密码子优化后合成斑马鱼g型溶菌酶基因,亚克隆至pET-28a(+)表达载体并转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,以IPTG进行诱导表达,并通过非干扰型蛋白浓度测定试剂盒和溶菌酶测定试剂盒(比浊法)测定其浓度及溶菌活性.[结果]从GenBank检索获得的斑马鱼溶菌酶基因g1(NM_001002706.1)和g2(XM_002664371.5)分别命名为Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2.Zeb-Lys-g1基因开放阅读框(ORF)长591 bp,共编码196个氨基酸残基,其编码蛋白分子量约21.6 kD;Zeb-Lys-g2的ORF长576 bp,共编码191个氨基酸残基,其编码蛋白分子量约21.1 kD;2种斑马鱼g型溶菌酶序列中均含有2个半胱氨酸残基及3个保守的催化残基位点(Glu、Asp和Asp).Zeb-Lys-g1的N端含有17个氨基酸的信号肽,而Zeb-Lys-g2不存在典型的信号肽结构,但其三级结构均具有多个α-螺旋结构.在基于溶菌酶序列相似性构建的系统发育进化树中,Zeb-Lys-g1序列与金鱼g型溶菌酶序列的亲缘关系最近,而Zeb-Lys-g2序列与鲈形目和鲽形目鱼类的g型溶菌酶序列亲缘关系较近.将合成的斑马鱼g型溶菌酶基因(Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2)亚克隆至pET-28a(+)表达载体并转化BL21(DE3)感受态细胞,20℃下经IPTG(终浓度0.5 mmol/L)诱导16 h,可获得融合蛋白Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2,纯化后的浓度分别为1.01和1.66 mg/mL,对应的溶菌活性分别为689.68和44.39 U/mg.[结论]鱼类g型溶菌酶的基因变异较保守,经密码子优化及全基因合成方式合成的斑马鱼g型溶菌酶基因Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2可通过原核表达获得高纯度、高溶菌活性的融合蛋白,为探究斑马鱼溶菌酶的抗菌机制提供了技术支持.

关键词：

斑马鱼g型溶菌酶序列特征原核表达溶菌活性

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半枝莲联合针灸对2型糖尿病大鼠肝脾肺组织结构的保护作用

鲜淼李玉洁范莹瑛陈宇鹏...

238-247页

查看更多>>摘要：[目的]明确半枝莲醇提物联合针灸对2型糖尿病(T2DM)的治疗效果,为动物T2DM提供有效的治疗手段,进而保障宠物业的健康发展.[方法]选取60只4周龄的SPF级近交系Wistar雄性大鼠随机分为2组,健康对照组(H组)15只和建模组(M组)45只;链脲佐菌素(45 mg/kg)联合高糖高脂诱导构建T2DM大鼠模型,建模成功后将其随机分为模型对照组(M组,15只)、半枝莲治疗组(S组,15只)及半枝莲联合针灸治疗组(A组,15只,针灸穴位包括脾俞、肾俞、三阴交和足三里).对A组和S组进行3个疗程(每疗程6 d)的治疗,分别于治疗第7、14和21 d采集各处理组大鼠的尾静脉血测定空腹血糖(FBG),同时各处理组分别处死5只大鼠,取肝脏、脾脏和肺脏固定后制作石蜡切片,肝脏和脾脏采用HE染色,肺脏采用HE染色和Masson染色,观察其组织结构病理变化.[结果]与H组相比,M组大鼠的体重极显著下降(P<0.01,下同),而FBG极显著升高;肝脏细胞由水肿发展为脂肪变性或局灶性坏死,炎症细胞浸润逐渐增强;脾脏组织局部细胞坏死,红髓和白髓分布混乱,淋巴细胞减少且排列紊乱;肺脏肺泡内出血,支气管黏膜下层和血管壁胶原纤维增生,最终导致部分肺泡萎陷或实变消失.与M组相比,A组和S组大鼠的体重呈增长趋势,至治疗第21 d极显著升高,而FBG在治疗第14和21 d均极显著降低;肝脏脂肪变性得到改善、水肿减轻、炎症细胞浸润减少;脾脏红髓和白髓结构、生发中心均逐渐趋于正常,淋巴细胞数量和脾小结数量均增多,且A组大鼠的增加数量多于S组大鼠;肺脏内出血减轻、炎症细胞减少,A组大鼠肺脏的肺间隔增厚程度低于S组大鼠.[结论]STZ联合高脂高糖诱导T2DM大鼠模型稳定,能对大鼠肝脏、脾脏和肺脏造成损伤.半枝莲或半枝莲联合针灸治疗对T2DM大鼠肝脏、脾脏和肺脏组织结构均具有较好的改善效果,且以针灸配合半枝莲的效果更优.

关键词：

大鼠2型糖尿病(T2DM)半枝莲针灸肝脏脾脏肺脏组织结构

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不同生长阶段花鲈生长性状与体质量的相关性

雍许坤邱丽华李勇闫路路...

248-256页

查看更多>>摘要：[目的]筛选出花鲈(Lateolabrax maculatus)各生长阶段对体质量有显著影响的主要生长性状,为开展花鲈选育工作时不同阶段应采取何种筛选标准提供理论依据.[方法]采用室外池塘养殖模式对花鲈(平均体质量12.29～599.33 g)开展为期250 d的养殖试验,每隔50 d随机采样测量其表型性状,包括体质量、全长、体长、眼径、头高、头长、上颌长、躯干长、尾鳍长、体高、尾长、尾柄高和吻长,并对不同生长阶段的表型性状进行相关分析、通径分析和多元回归分析,以及构建多元回归方程.[结果]在测定的13项花鲈表型性状中,除吻长外,其余性状均随养殖时间的延长而呈增长趋势.其中,花鲈的体质量从12.29±2.87 g增长至599.33±116.50 g,体长由86.73±7.75 mm增长至328.12±21.10 mm.花鲈体质量和体长的变异系数波动变化均不明显,分别为19.44％～24.74％和6.43％～9.09％.不同生长阶段与花鲈体质量相关性达显著或极显著水平的生长性状分别是:养殖第1 d为全长;养殖第50 d为体长、头高和吻长;养殖第100 d为体长和体高;养殖第150 d为体长、眼径、上颌长和体高;养殖第200 d为体长、躯干长和体高;养殖第250 d为体长和头高.通径分析结果表明,养殖第1 d以全长对花鲈体质量的直接作用最大(通径系数为0.894);养殖第50 d、第100 d、第150 d和第250 d均以体长对花鲈体质量的直接作用最大,通径系数分别为0.531、0.663、0.403和0.686;养殖第200 d则以体高对花鲈体质量的直接作用最大(通径系数为0.511).[结论]在不同生长阶段与花鲈体质量显著或极显著相关的生长性状也各不相同.花鲈平均体质量为12.29 g时全长与体质量的相关性最大,平均体质量在70.25～599.33 g时体长与体质量的相关性较大;花鲈的体质量还与其体高和头高有相关性.因此,在花鲈选育过程中建议以体长为主要选育性状,同时辅以体高、全长和头高.

关键词：

花鲈生长性状体质量相关分析通径分析多元回归方程

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基于易腐特性的我国柑橘市场价格波动风险分析

胡友陈昕祁春节

257-267页

查看更多>>摘要：[目的]基于易腐特性探讨柑橘市场价格波动的风险特征,对于把握柑橘市场发展规律、促进我国柑橘产业持续发展具有重要意义.[方法]基于2016年1月1日—2020年12月31日的日频数据,运用VaR方法和GARCH及其衍生的EGARCH模型,从易腐特性角度比较研究蜜桔、砂糖橘、芦柑、脐橙、甜橙和沙田柚等柑橘市场价格波动风险.[结果]易腐特性是柑橘价格波动风险的重要影响因素,即相较弱易腐性的柑橘水果而言,强易腐性的柑橘水果价格波动幅度更大,波动频率更高.风险价值分析结果表明,在90％置信水平下我国各品类柑橘价格波动的风险价值均高于安全阈值,且强易腐性柑橘的价格涨跌风险高于弱易腐性柑橘,表明不同品类柑橘的价格风险与其易腐特性强度密切相关.风险特征分析结果表明,各品类柑橘价格波动均具有较强的集簇性特征,且强易腐性柑橘价格波动的集簇性程度普遍高于弱易腐性柑橘,导致其价格风险更加难以预测,可能陷入连续下跌的境地.各品类柑橘价格波动对外部冲击的反应均呈现出明显的不对称性,且强易腐性柑橘价格波动对负向信息冲击的反应更强,更加容易被引发出剧烈震荡.[建议]构建柑橘价格波动预警机制,及时监测市场风险;推动柑橘贮藏保鲜设施建设,稳定市场价格波动;实施品类差异化的柑橘市场保险机制,降低市场经营风险.

关键词：

柑橘市场易腐特性价格波动风险价值法(VaR)GARCH及其衍生模型

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基于Logit-Tobit的河南省粮食主产区农地流转影响因素分析

孟俊杰乔鹏程李柯王静...

268-276页

查看更多>>摘要：[目的]探索农民农地流转行为和规模的影响因素,为推进粮食主产区农地流转和农业适度规模经营提供政策依据.[方法]基于河南省8县(市)问卷调研数据,选取户主特征、家庭经营特征、区域经济特征3个方面11个具体变量,构建Logit模型分析变量对农户转出和转入行为的影响,再利用Tobit模型对转出和转入实际规模影响因素进行进一步分析.[结果]影响农户农地转入和转出的因素不尽相同,影响流转行为和流转规模的影响因素基本相同,但显著水平有比较明显的差别.对农地转出呈正向显著影响的主要因素有非农收入比重、流转期限、本村土地租金及村集体是否组织流转等,其中非农收入比重、流转期限对转出行为和转出规模均在5％统计水平下显著.对农地转入呈负向显著影响的主要因素有非农收入比重、本村土地租金,呈正向显著影响的有流转期限、家庭农业劳动力数量、家庭是否拥有大中型农业机械、地区类型等,其中非农收入比重、流转期限、家庭农业劳动力数量等变量对转入行为和转入规模均在5％统计水平下显著.[建议]从农地流转主要影响因素着力,推动农村劳动力从事二三产业,加大对新型农业经营主体财政金融等政策支持力度,发挥集体经济组织等中介组织中介、合同管理作用,适时合理调整租金水平,从而促进农地流转和农业适度规模经营.

关键词：

农地流转影响因素Logit-Tobit模型粮食主产区河南省

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