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期刊信息/Journal information
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院
南方农业学报

广西壮族自治区农业科学院

李杨瑞

月刊

2095-1191

nfnyxb@163.com

0771-3243905、3244920

530007

广西南宁市大学东路174号

南方农业学报/Journal Journal of Southern AgricultureCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是由广西农业科学院主办的综合性农业科技期刊,主要报道农业科研新成果、新技术、新方法,农业生产新经验、新产业等。
正式出版
收录年代

    191份云南野生甘蔗种质资源采集及遗传多样性分析

    徐超华陈学宽毛钧赵培方...
    3125-3135页
    查看更多>>摘要:[目的]收集云南野生甘蔗种质资源,并进行遗传多样性分析,筛选出优异种质资源,为甘蔗遗传改良提供优良亲本,也为利用和保护甘蔗野生种质资源提供理论依据.[方法]甘蔗野生种质资源采集按每隔30 km或海拔落差100 m取样1次,记录考察采集路线地理信息,调查表型性状和采集图像,并取地下根茎(地下种芽)样本保存.通过遗传变异、相关性及聚类分析对6个表型性状进行综合评价,并分析其遗传多样性.[结果]甘蔗野生资源考察队历时20 d途经11个县(市)51个乡镇,共采集到191份甘蔗野生种质资源,隶属于3个属5个种,其中滇蔗茅(Erianthus rockii)42份、割手密(Sacchuram spontaneum)53份、芒(Micanthus sinensis)20份、斑茅(Erianthus arundinacius)35份、蔗茅(Erianthus fulvus)41份,主要分布于101°51′0″E~104°36′0″E,23°12′0″N~25°18′0″N和海拔208.45~2238.71 m地理区域.甘蔗野生资源种间表型性状变异丰富,表型性状的变异系数18.30%~51.70%,其中割手密的平均变异系数最高,为40.95%,其次为斑茅,平均变异系数为38.61%,芒的平均变异系数最小,为33.80%.纬度和海拔均与叶宽、株高和茎径均呈极显著负相关,而锤度与经度、纬度和海拔无显著(P>0.05)相关性.通过聚类分析及优异资源筛选,发现滇蔗茅种质第Ⅲ大类群(Er2021-29)、割手密种质第Ⅱ类群(Sp2021-25、Sp2021-26和Sp2021-21)、芒种质第Ⅱ类群(Ma2021-15),斑茅种质第Ⅳ大类群(Ea2021-8)、蔗茅种质第Ⅰ大类群(Ef2021-1)共7份材料产量性状和品质性状优良.[结论]此次野生甘蔗种质资源采集行动弥补国家甘蔗种质资源圃(开远)在云南省境内部分县(市)考察盲区系统调查的空白,且采集的191份甘蔗野生种质资源表型性状具有丰富的遗传多样性,部分特异材料具有其他甘蔗野生资源所不具备的优异性状,有7份种质综合表现优异,具有较大的利用潜力.

    甘蔗种质资源农艺性状遗传多样性

    可可毛色二孢AM2As全基因组分泌蛋白的预测及功能分析

    禄锦鹏秦春秀李潇陈代朋...
    3136-3155页
    查看更多>>摘要:[目的]对可可毛色二孢AM2As全基因组编码分泌蛋白进行预测及功能分析,为挖掘该病原菌关键致病基因及可可抗病基因提供理论参考.[方法]根据NCBI数据库已公布的可可毛色二孢全基因组序列,利用SignalP v5.0、ProtComp v9.0、TMHMM v2.0、GPI-SOM,LiPop v1.0等生物信息学软件对其分泌蛋白序列进行预测筛选及功能分析,并依据分泌蛋白序列的相似性,应用PHI1 COG和eggNOG-mcpper v5.0数据库进行功能注释分析,再利用MEGA X、GSDS v2.0、TBtools v1.09等软件对分泌蛋白组进行系统发育进化及其基因结构和启动子顺式作用元件分析.[结果]可可毛色二孢全基因组共编码13054个蛋白,有638个蛋白具有潜在典型分泌蛋白特征,占总数4.89%.638个分泌蛋白的氨基酸数量为55~1777个,其中以100~400个氨基酸居多,占分泌蛋白序列总数的53.76%,说明大多数分泌蛋白属于小型蛋白.20种氨基酸数量和占比在638个分泌蛋白中存在明显差异,Ala占比最高,其余氨基酸种类占比均未超过10%.638个分泌蛋白的信号肽氨基酸数量为15~38个,其中有409个分泌蛋白的信号肽氨基酸数量为17~20个;以非极性氨基酸Ala占比最高,而有带电侧链的Asp和Glu占比最低.信号肽-3和-1位上氨基酸相对保守,切割位点属于 A-X-A 类型,可被 Sp I 型信号肽酶识别并切割.将638个分泌蛋白分为七大类群,不同类群成员在蛋白结构、功能和保守基序上呈明显差异.400个分泌蛋白获得功能注释,主要涉及碳水化合物运输、代谢过程、蛋白翻译后修饰和氨基酸代谢、运输过程.分泌蛋白组中共预测出221个CAZymes和244个效应蛋白,其中48个效应蛋白可通过PHI数据库得到功能注释.[结论]可可毛色二孢分泌蛋白功能主要集中在碳水化合物的运输、代谢、翻译后修饰和氨基酸代谢等过程,还有其他未知功能和致病功能,初步推断可可毛色二孢AM2As在侵染致病过程中,受脱落酸反应、生长素反应以及低温厌氧反应、光反应等顺式作用元件调控,通过分泌大量碳水化合物降解、代谢、转运等相关蛋白,建立寄生关系,再利用代谢产物帮助自身加速侵染,到达致病的作用.

    可可毛色二孢分泌蛋白基因家族效应蛋白

    外源生长素影响百合地下茎生鳞茎发生的转录组分析

    杨成龙方少忠黄永旺陈佩振...
    3156-3164页
    查看更多>>摘要:[目的]揭示激素调控百合地下茎生鳞茎发生发育的分子机理,为深入开展生长素相关基因调节百合地下茎生鳞茎发生分子机制研究提供参考依据.[方法]通过0.2和2.0 mmol/L浓度的外源生长素吲哚乙酸(IAA)对百合地下茎部进行处理,以清水处理作为对照(CK),对收获的地下茎生鳞茎的数量和重量进行测定,结合转录组测序分析,揭示不同浓度生长素处理下各激素相关基因的时空表达模式,并利用实时荧光定量PCR技术对百合侧生器官发生关键基因进行表达水平检测.[结果]2.0 mmol/L 浓度IAA处理后的百合植株,在茎生鳞茎总数量、单株茎生鳞茎数量和茎生鳞茎平均克重均低于0.2 mmol/L处理和CK.KEEG富集结果指向植物激素信号转导通路,差异基因数字表达谱显示,几乎所有与植物激素相关的基因均受影响,包括生长素、乙烯、脱落酸、油菜素内酯、茉莉酸甲酯、细胞分裂素和赤霉素,其中茉莉酸甲酯相关的差异基因最多,其次为生长素.实时荧光定量PCR检测表明,2.0 mmol/L处理中WOX9、WOX11、KNOX2、CYCD3和CYCD5基因表达水平均显著低于CK(P<0.05,下同).[结论]高浓度生长素IAA可有效迟滞百合地下茎生鳞茎的形成和发育.外源生长素处理不仅影响多种植物激素的合成代谢、运输和信号转导,也抑制百合侧生器官发生关键基因的表达,从而影响地下茎生鳞茎的形成和发育.

    百合生长素茎生鳞茎转录组测序珠芽

    妮娜皇后葡萄需冷量及休眠解除过程中相关基因表达分析

    黄泳碧覃园媛陆秀边白扬...
    3165-3173页
    查看更多>>摘要:[目的]分析妮娜皇后葡萄需冷量及休眠解除过程中相关基因表达,为该品种在广西葡萄产区引种推广及其休眠解除机制的研究提供理论参考.[方法]以3年生妮娜皇后葡萄为试验材料,采用0~7.2℃估算模型,对采后修剪枝段进行(4±1)℃下0、312、408 和504 h共4个不同时长的低温处理,通过水培调查计算各低温时长处理枝段萌芽率并对比3%浓度单氰胺破眠剂处理下的枝段萌芽率确定其需冷量范围;测定各处理枝段中可溶性总糖与淀粉含量;通过实时荧光定量PCR检测芽内5个芽休眠解除关键基因的相对表达量.[结果]妮娜皇后葡萄低温处理312 h后,水培4周萌芽率均高于50%,且均与相同低温处理取样后进行单氰胺处理的萌芽率无显著差异(P>0.05),结合采样前自然条件下0~7.2℃的低温积累时数37 h,将低温处理时间与自然积累的低温时数相加估算其需冷量<349 h;妮娜皇后葡萄芽休眠解除过程中,枝条中的淀粉含量显著降低(P<0.05,下同),淀粉转化为可溶性糖,可溶性糖含量显著增加.与未经低温处理(0 h)相比,低温处理后妮娜皇后芽中ABA合成酶基因VvNCED1、ABA降解酶基因VvA8H4、ABA调节的胼胝质合成酶基因VvCALS1和胼胝质水解酶基因VvGLU1等4个关键休眠基因的相对表达量均显著增加,ABA合成酶基因VvXERICO相对表达量显著降低.[结论]低温处理能通过降低妮娜皇后葡萄枝条中淀粉含量,增加可溶性总糖含量,并进一步上调葡萄芽内ABA降解酶基因和胼胝质水解酶基因的表达解除芽休眠.妮娜皇后葡萄为低需冷量品种,适宜在广西葡萄产区种植.

    妮娜皇后葡萄需冷量休眠解除基因表达广西

    郁金香不同组织内参基因筛选及稳定表达分析

    巨秀婷何金娣张梦洁张国莉...
    3174-3185页
    查看更多>>摘要:[目的]筛选郁金香在盐胁迫条件下稳定表达的内参基因,为开展郁金香耐盐相关基因表达调控相关研究提供理论参考.[方法]以郁金香栽培品种红色印象为材料,于苗期对其进行盐胁迫处理,不同时间(0、2、4、6、8、10、12、24和48 h)采集根、鳞茎和叶,通过实时荧光定量PCR检测候选内参基因在郁金香不同组织中的表达情况,计算每个样本的平均Ct值,再结合3个常用内参基因稳定性评估软件(geNorm、NormFinder、BestKeeper)的分析结果,利用RelFinder在线软件综合评价候选内参基因的表达稳定性,并通过目的基因质膜Na+/H+逆向转运蛋白基因(SOS1)和液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因(NHX1)的表达分析验证内参基因的可靠性.[结果]在15个候选内参基因中筛选到9个可用于郁金香各组织实时荧光定量PCR的内参基因.候选内参基因的Ct值分析结果显示,25S rRNA在不同组织中的平均Ct值最低,表达丰度最高,Ct值分布范围相对集中,是根、鳞茎和叶均能稳定表达的内参基因.geNorm和NormFinder分析结果均显示,18S rRNA均能在根、鳞茎和叶中稳定表达,25S rRNA在根和叶中表现出较好的基因稳定性,NADP基因在鳞茎中基因稳定性较好.BestKeeper分析结果显示,根、鳞茎和叶组织中最佳的内参基因为25S rRNA,同时18S rRNA在根和叶中稳定性较好.结合上述4种分析结果通过RefFinder软件得到各候选基因在郁金香不同组织中的表达稳定性综合排名,其中根组织:25S rRNA>18S rRNA>TUB-6>EF1α>NADP>EF-1α>β-actin;鳞茎组织:NADP>25S rRNA>18S rRNA>EF-1α>EF1α>TUB-6;叶组织:25S rRNA>18S rRNA>EF-1α>CYP>UBC.[结论]9个候选内参基因在郁金香不同组织中的表达情况存在差异,25S rRNA和18S rRNA是在郁金香各组织的不同盐胁迫处理中稳定表达的内参基因,同时使用2个内参基因更有利于得到准确的基因表达定量结果.

    郁金香内参基因实时荧光定量PCR筛选盐胁迫

    不同株型水稻的农艺性状表现及其主效基因多态性

    苟兆霞梁程傅娅菲徐浩扬...
    3186-3197页
    查看更多>>摘要:[目的]分析不同株型水稻的农艺性状及其主效基因多态性,揭示不同株型水稻的产量性状和遗传基础,为理想株型育种提供理论参考.[方法]以理想株型品系少蘖粳为对照,从背背糯、粳糯1号及个重组自交系中发现的自然重组新种质RIL60和RIL61为材料,探究不同株型水稻的农艺性状表现和遗传差异,比较其在不同发育期(10、17、24和31 DAF)的株型特点,同时对5份种质进行理想株型基因IPA1、Gn1a和DEP1及糯性基因Wx的基因型鉴定.[结果]少蘖粳为ipa1和gn1a-m1突变型,其叶部性状与其他种质差异较大,具有剑叶长、倒三叶短和叶窄的特点,在4个发育期茎、叶、穗干量均小于其他种质,但其穗干重在不同发育期中的增幅大于其他种质,表明该种质在相同时间内具有更强的光能利用率和干物质积累率,其千粒重较其余4份种质具有较大优势.RIL60的功能叶叶角度与其他种质有较大差异,其呈塔型的特点更有利于光合产物的积累,故更接近理想株型形态,其穗重低于RIL61,但其单株有效穗数较RIL61显著增加(P<0.05,下同),导致其单株产量与RIL61无显著差异(P>0.05).RIL61在4个发育期中功能叶叶面积较其他4个种质更具优势.背背糯为dep1突变型,有更紧凑的株型和直立穗,在前期穗干物质积累量较低,但在31 DAF时期超过其他种质,具有更多的一次和二次分枝,穗间紧密,属于重穗型种质,说明其光合产物的转换能力较强.粳糯1号在穗重和着粒密度等性状上均无优势,但由于其有效穗数最多,故单株产量最高.影响理想株型水稻产量的穗部指标权重为单株有效穗数>穗重>千粒重.[结论]RIL60和少孽粳基本符合无效分蘖少、每穗实粒数多、优良的受光姿态、厚且结实的茎秆等理想株型特征,可作为理想株型育种种质.粳糯1号的株型较好且有较多的单株有效分蘖数和较高的单株产量,也可作为理想株型育种的亲本.在今后理想株型育种时,应优先考虑穗重和单株有效穗数,选择穗大、有效分蘖数多的种质,适当降低对千粒重的要求,且尽量选择含IPA1和DEP1等有利等位基因的种质,才有望育成具有理想株型的高产水稻品种.

    水稻(OryzasativaL.)理想株型农艺性状IPA1GN1ADEP1waxy(wx)

    等氮量有机替代水稻种植对水土环境和农学效应的影响

    付斌王炽胡万里闫辉...
    3198-3205页
    查看更多>>摘要:[目的]研究等氮量有机替代在水稻生产中对水土环境和农学效应的影响,筛选适合高原湖泊流域农业生产的有机替代方式,为防控农业面源污染提供技术支持.[方法]在洱海流域进行等氮量有机替代水稻种植田间试验,设不施肥处理(CK)、等氮量100%化学氮肥处理(CF)、等氮量50%有机肥+50%化学氮肥处理(FM)和等氮量100%有机肥处理(CM).系统分析水稻生育期内田面水和土壤无机氮浓度动态变化特征,以及水稻产量和氮素养分利用农学效应.[结果]水稻返青期(移栽后0~7 d)是防止田面水氮素流失的关键风险期,田面水铵态氮浓度峰值:FM(20.92 mg/L)>CF(20.07 mg/L)>CM(8.60 mg/L)>CK(6.82 mg/L);田面水硝态氮浓度峰值:CM(5.83 mg/L)>CF(3.63 mg/L)>CK(3.14 mg/L)>FM(2.98 mg/L).全量有机替代CM处理相比单施化肥CF处理降低水稻返青期田面水铵态氮浓度42.23%,增加硝态氮浓度134.11%.水稻孕穗期(移栽后31~60 d)是水稻土硝态氮淋溶流失的关键风险期,水稻土硝态氮平均含量:CF(11.37 mg/kg)>CM(10.66 mg/kg)>FM(8.71 mg/kg)>CK(7.11 mg/kg),等氮量有机无机配施明显降低土壤硝态氮含量,FM处理分别较CF和CM处理降低23.39%和18.29%.等氮量有机替代的FM和CM处理相比单施化肥CF处理提高水稻籽粒产量和籽粒吸氮量,FM处理增幅分别为9.30%和45.28%,CM处理增幅分别为7.85%和16.51%;等氮量有机替代(CM和FM处理)显著提高水稻氮肥贡献率(增幅31.83%和37.20%)和氮肥农学效率(增幅42.22%和50.00%)(P<0.05).[结论]等氮量50%有机肥+50%化学氮肥可减少尿素施用量,稳定水稻生产,提高氮肥利用效率,同时降低稻田氮素流失风险.

    有机替代水稻种植水土环境农学效应

    有机肥等氮替代对水稻根区土壤结构环境及根活力的影响

    李诗张俊辉胡钧铭周凤珏...
    3206-3216页
    查看更多>>摘要:[目的]探究有机肥等氮替代对水稻与根区土壤结构环境、土壤微生物量碳及水稻根系生长的影响,为南方集约化双季稻生产相匹配的减肥增效种植制度优化提供理论依据.[方法]依托广西南宁双季籼稻典型区环境,设不施肥对照(CK)、无机氮(T1,化肥)、无机氮+有机氮(T2,绿肥+化肥)和有机氮(T3,绿肥+生物炭+蚕沙+无氮化肥)4个定位处理.在水稻移栽后返青至晒田根系形成的关键期内,分别于移栽后7、14、21、35和42 d采集水稻植株和根区土壤样品,系统分析水稻根系生长及土壤团聚体结构和微生物量碳含量变化.[结果]等氮替代可促进土壤水稳性团聚体形成,增加微生物量碳含量.早稻季,各处理中小团聚体(Ⅱ~Ⅴ级)总含量表现为T2(21.44%)>T3(18.85%)>T1(13.4%)>CK(7.65%),T2和T3处理的微团聚体含量(Ⅵ~Ⅶ级)高于CK和T1处理,T2处理的土壤水稳性团聚体平均质量直径(MWD)低于其他处理;晚稻季,各处理中小团聚体总含量依次为T2(21.44%)>T3(18.85%)>CK(12.11%)>T1(7.70%),T2和T3处理的微团聚体(Ⅵ~Ⅶ级)含量较高、MWD较低;双季稻T2和T3处理的几何平均值径(GMD)均显著低于T1和CK处理(P<0.05,下同),微生物量碳含量依次为T2>T3>T1>CK.等氮替代改变水稻根体积与根系活力,增强了植株养分吸收力.早稻季,移栽后42 d根体积和根活跃吸收面积均表现为T2>T1>T3>CK;晚稻季,移栽后42 d根体积表现与早稻季一致,根活跃吸收面积表现为T1>T2>CK>T3.等氮替代影响水稻根冠比和干物质积累.早稻季,随移栽时间的延长,各处理的根冠比整体呈先升后降的变化趋势,均在水稻移栽后21 d出现峰值;晚稻季,各处理的根冠比峰值不明显;移栽后42 d,植株干物质重在各处理间差异显著,均表现为T2>T1>T3>CK.[结论]绿肥、生物炭与蚕沙可促进土壤水稳性团聚体形成,增大微生物量碳含量,利于稻根生长发育,与种植制度匹配的有机肥等氮替代生产模式可作为南方双季籼稻区集约化水稻减肥增效的重要优化措施.

    水稻等氮替代有机氮根际土壤结构根活力干物质重

    不同年限三七根系丛枝菌根真菌多样性及其与土壤理化性质的相关分析

    杨双琳邓利娟黄博王益锋...
    3217-3227页
    查看更多>>摘要:[目的]明确不同年限三七根系丛枝菌根真菌(AMF)多样性、群落结构差异及其与根际土壤理化性质的关系,为AMF在缓解三七连作障碍中的应用提供参考依据.[方法]以1年生、2年生和3年生三七根系及根际土壤为试验材料,采用显微形态法观察并测定根系AMF侵染率,通过Illumina高通量测序技术分析不同年限三七根系AMF多样性和群落结构差异,探讨三七根系AMF多样性和相对丰度与根际土壤理化性质的相关性.[结果]三七根系AMF侵染率在83%~95%,且随着种植年限延长,根际土壤的碱解氮、全氮和全磷含量逐渐减少,有效磷和速效钾含量先降低后升高,土壤酸化加强.通过高通量测序技术在三七根系中共检测到55个OTUs,排除不可归类,分属于球囊霉属(Glomeromycetes)的4目6科7属19种,其中球囊霉属(Glomus)占比最高(达43.99%).多样性分析结果发现,对比其他2个年限,3年生三七根系OTUs最少,且多样性和丰富度最低.偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)结果表明,不同年限三七根系AMF群落结构差异明显,其中球囊霉属是1年生和3年生三七根系的优势属(占比分别为32.31%和53.68%),类球囊霉属(Paraglomus)为2年生三七的优势属(占比50.39%).相关分析结果发现,三七根系AMF的ACE和Chao指数与根际土壤全磷含量呈显著正相关(P<0.05,下同),与有效磷和速效钾含量呈显著或极显著(P<0.01)负相关.[结论]不同年限三七根系AMF的丰富度和群落结构存在明显差异,随种植年限增加,三七根系AMF丰富度和OTUs逐渐降低,但球囊霉属相对丰富度逐渐上升.在三七根际土壤中,有效磷和速效钾含量是影响其根系AMF群落结构的主要因素.

    三七根系丛枝菌根真菌群落结构土壤理化性质相关性

    广东省大豆农家种芽期耐盐性鉴定

    刘双幸赖剑云李红梅陈沛...
    3228-3238页
    查看更多>>摘要:[目的]鉴定广东省大豆农家种芽期耐盐性,发掘广东省大豆农家种中潜在的优异性状,筛选出耐盐性较强的种质资源,为耐盐品种的改良和培育提供优质亲本材料.[方法]以102份广东农家大豆种质资源为试验材料,用150 mmol/L NaCl进行盐胁迫处理,以蒸馏水为对照,处理后测定发芽势、发芽率、盐害指数、胚轴长、胚根长、鲜重和干重,根据盐害指数进行耐盐性初步分级,计算其余指标相对值并进行相关分析,采用主成分分析法和隶属函数法计算综合评价D值,并进行耐盐性排序,使用聚类分析法筛选耐盐性较强的种质资源.[结果]耐盐性初步分级结果显示,102份种质资源中,高耐种质资源占比最多,较耐种质资源次之,中耐和较敏感种质资源占比相同,无敏感种质资源.与对照相比,盐胁迫下大豆芽期指标均降低,其受抑制程度排序为胚根长>胚轴长>鲜重>干重>发芽势>发芽率,芽期胚根长受抑制作用较大,发芽率受抑制作用较小;相关分析结果显示,多数指标间均存在一定程度的相关性;通过主成分分析得到2个主成分,累积贡献率达88.17%,其中第一主成分(PC1)中特征向量绝对值最大的指标为相对发芽势,第二主成分(PC2)中特征向量绝对值最大的指标为相对发芽率和盐害指数;采用获得的2个主成分作为综合指标,根据综合评价D值进行耐盐性排序,排名前5的种质资源编号分别为374、310、358、357和309;通过聚类分析筛选出耐盐性较强的种质资源,编号分别为310、358、374和331.[结论]筛选出4份耐盐性较强的农家大豆种质资源,可作为亲本材料用于耐盐种质创制,或者作为抗盐渍种质资源用于盐渍化土地的开发利用.相对发芽势和相对发芽率指标可用于大豆耐盐性评价与耐盐种质资源筛选.

    大豆农家品种种质资源芽期耐盐鉴定