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期刊信息/Journal information
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院
南方农业学报

广西壮族自治区农业科学院

李杨瑞

月刊

2095-1191

nfnyxb@163.com

0771-3243905、3244920

530007

广西南宁市大学东路174号

南方农业学报/Journal Journal of Southern AgricultureCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是由广西农业科学院主办的综合性农业科技期刊，主要报道农业科研新成果、新技术、新方法，农业生产新经验、新产业等。
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    猪源hnRNPA1基因克隆及其真核表达载体构建

    王文锋高跃美金奕欣张丽媛...
    3426-3435页
    查看更多>>摘要：[目的]克隆猪源异质性核糖核蛋白A1(hnRNPA1)基因编码区(CDS)序列并构建其真核表达载体,为探究猪源hnRNPA1蛋白结构及其生物学特性提供理论参考.[方法]利用总RNA提取试剂盒提取PK-15细胞总RNA并反转录合成cDNA,以此为模板,采用SnapeGene设计hnRNPA1基因特异性扩增引物,PCR扩增获得hnRNPA1基因CDS序列.通过ProtParam、ExPASy-ProtScale、TMHMM-1.0、SignalP-6.0、SPOMA、SWISS-MODEL和NetPhos 3.1等预测hnRNPA1蛋白的理化性质、结构及磷酸化位点.构建pcDNA3.0-hnRNPA1-Flag真核表达载体并转染HEK-293T细胞,通过实时荧光定量PCR、Western blottiing和免疫荧光染色试验检测hnRNPA1基因真核表达载体构建情况、hnRNPA1蛋白在细胞中的表达及分布情况.[结果]成功克隆猪源hnRNPA1基因CDS序列.生物信息学分析结果显示,hnRNPA1基因CDS序列全长963 bp,编码320个氨基酸残基,hnRNPA1蛋白分子量约为35 kD,理论等电点(pI)为9.27,脂肪系数为38.34,不稳定系数为43.87(大于40.00),蛋白结构相对不稳定,总平均亲水性指数(GRAVY)为-0.879,属于亲水性蛋白,不含跨膜结构域和信号肽,二级结构由α-螺旋(16.56%)、无规则卷曲(72.50%)和延伸链(10.94%)组成,存在48个潜在的磷酸化位点.Western blotting检测结果显示,真核表达载体pcDNA3.0-hnRNPA1-Flag转染HEK-293T细胞后能成功表达hnRNPA1蛋白.免疫荧光染色结果显示,hnRNPA1蛋白主要在胞质中表达.[结论]成功克隆猪源hnRNPA1基因CDS序列.猪源hnRNPA1蛋白为不稳定的亲水性蛋白,不含跨膜结构域和信号肽,二级结构主要为无规则卷曲.成功构建pcDNA3.0-hnRNPA1-Flag真核表达载体,hnRNPA1蛋白主要在胞质中表达.

    猪hnRNPA1基因生物信息学分析表达载体构建

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    饥饿胁迫对花鲈幼鱼摄食行为的分子调控研究

    张瑞琼邱丽华李太初张博...
    3436-3443页
    查看更多>>摘要：[目的]探究饥饿胁迫对花鲈幼鱼摄食行为的分子调控,为应对花鲈饥饿胁迫和解析饥饿胁迫对花鲈摄食行为的影响提供理论参考.[方法]以花鲈幼鱼为研究对象,饥饿处理后检测饥饿胁迫对花鲈幼鱼体质量和摄食率的影响及饥饿胁迫对摄食相关基因相对表达量的影响.饥饿再投喂处理后,实时荧光定量PCR检测饥饿再投喂对花鲈幼鱼摄食相关基因相对表达量的影响.[结果]短期饥饿和中长期饥饿处理后花鲈幼鱼体质量和增重率均显著降低(P<0.05,下同),食欲生成相关基因相对表达量均显著升高,厌食生成相关基因相对表达量均显著降低.短期饥饿再投喂花鲈幼鱼摄食率能恢复到正常水平,食欲生成相关基因npy、agrp、mch和galanin相对表达量逐渐降低,投喂3 d后恢复到对照组水平;厌食生成相关基因m-tor、pomc和α-msh相对表达量逐渐升高.长期饥饿再投喂花鲈幼鱼食摄食率不能恢复至正常水平,食欲生成相关基因npy、agrp、mch、galanin和厌食生成相关基因leptin、m-tor、pomc和α-msh相对表达量均逐渐升高.[结论]短期饥饿胁迫和中长期饥饿胁迫花鲈幼鱼体质量和增重率均显著下降,短期饥饿再投喂花鲈幼鱼摄食率能恢复至正常水平,食欲生成相关基因相对表达量逐渐降低,厌食生成相关基因(m-tor、pomc和α-msh)相对表达量逐渐升高;中长期饥饿再投喂花鲈幼鱼摄食率不能恢复至正常水平,食欲生成相关基因和厌食生成相关基因相对表达量均呈逐渐升高的变化趋势.

    花鲈饥饿胁迫食欲生成因子厌食生成因子

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    武隆人工养殖大鲵重金属富集分析与食用评价

    董悦玲蔡明成兰宗宝李晓英...
    3444-3452页
    查看更多>>摘要：[目的]研究武隆大鲵养殖环境质量及其食用对人体健康的潜在风险,为大鲵的清洁生产及其品质提升提供科学参考.[方法]采用火焰原子吸收分光光度法测定武隆大鲵养殖基地水体,以及1龄、3龄大鲵肌肉和肝脏组织中的铜(Cu)、铅(Pb)、锌(Zn)、铬(Cr)、镍(Ni)、锰(Mn)重金属含量,分析重金属迁移富集特征.利用单因子污染指数法和内梅罗综合污染指数法评价重金属污染程度;利用生物富集系数(BCF)、生物积累系数(BAF)、目标危害系数(THQ)和总目标危害系数(TTHQ)对食用大鲵各组织器官的潜在人体健康风险进行评价.[结果]基地养殖水体和大鲵肌肉、肝脏中Cu、Pb、Zn、Cr、Ni、Mn平均含量分别为0.0030、0.0280、0.0008、0.0030、0.0105、0.0061 mg/L和1.0002、0.3616、8.3566、0.0230、0.0075、0.1982 mg/kg,均未超出我国食品质量标准值,养殖水体无明显重金属污染;但大鲵肌肉和肝脏中的Pb含量超过联合国粮食及农业组织和联合国世界卫生组织(FAO/WHO)及欧盟委员会的限量值(0.3 mg/kg),存在Pb污染风险.大鲵肌肉和肝脏组织对Zn和Cu的富集能力较强,且Zn的BCF随大鲵的年龄增长而增加;与肌肉相比,肝脏的富集能力更强,食用风险更大.THQ和TTHQ均小于1,食用大鲵各组织无明显的健康风险,但Pb对TTHQ的贡献率较大.[结论]武隆养殖基地大鲵的食用对人群无明显的重金属危害风险,食用安全性高;但应加强对养殖水体Pb的来源控制和大鲵体内Pb的监测,有助于重庆武隆大鲵食用品质的提升.

    武隆大鲵重金属污染健康风险目标危害系数

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    A型塞内卡病毒SVA/CH-GX01-2020株全基因组特征分析

    王睿敏施开创冯淑萍尹彦文...
    3453-3462页
    查看更多>>摘要：[目的]通过对A型塞内卡病毒(SVA)广西分离株全基因组特征进行深入分析,了解其病原特征和分子流行病学特点,为有效防止疫情暴发和流行提供理论依据.[方法]对2020年采集自广西的病料进行病毒分离,通过RT-PCR检测和间接免疫荧光试验(IFA)进行鉴定.对SVA分离株全基因组进行分段扩增和测序后,采用Lasergene 7.1拼接序列,使用MegAlign将SVA分离株全基因组序列与国内外不同年份的55株SVA代表毒株进行比对,利用MEGA 11.0构建系统发育进化树.[结果]经鉴定分离到1株SVA,命名为SVA/CH-GX01-2020株.SVA/CH-GX01-2020株基因组全长为7250 bp,开放阅读框(ORF)编码2181个氨基酸残基.与国内外不同年份的55株SVA代表毒株进行比对,结果显示,SVA/CH-GX01-2020株与国内外SVA分离株全基因组的核苷酸序列及其推导氨基酸序列的相似性分别为93.3%～98.7%和97.3%～99.6%,其中,与美国经典毒株SVV-001和ATCC PTA-5343全基因组相似性较低.遗传进化分析发现,SVA/CH-GX01-2020株与美国经典毒株SVV-001和ATCC PTA-5343亲缘关系较远,与大多数中国分离株聚在同一分支,亲缘关系较近,与广西分离株SVA/GX/CH/2018亲缘关系非常近.进行氨基酸序列比对分析发现,与美国经典毒株SVV-001、中国首株分离株CH-01-2015、广西分离株SVA/GX/CH/2018相比,SVA/CH-GX01-2020株氨基酸突变位点主要集中在非结构蛋白3D区域,在结构蛋白VP4和非结构蛋白2A区域相对保守.[结论]SVA/CH-GX01-2020株具有其独特的遗传变异特点,不同地域的SVA毒株亲缘关系远近程度不同,临床流行毒株具有遗传多样性,应加强疫情监测和流行病学调查.

    A型塞内卡病毒病毒分离系统发育进化树基因组特征遗传变异

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    黄喉拟水龟ISG15基因cDNA序列克隆及其表达特征分析

    陈铭曲彭文韩鹏夫纪月鑫...
    3463-3473页
    查看更多>>摘要：[目的]克隆黄喉拟水龟(Mauremys mutica)干扰素刺激基因15(ISG15)并分析其表达特征,为探究ISG15蛋白在黄喉拟水龟抗病原微生物侵袭过程中的免疫功能和作用机制提供理论依据.[方法]应用RACE克隆黄喉拟水龟ISG15基因(MmISG15)cDNA全长序列,进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR检测MmISG15基因在健康黄喉拟水龟不同组织中的表达情况,并检测黄喉拟水龟受脂多糖(LPS)、多肌胞苷酸[Poly(I∶C)]和肺炎克雷伯氏菌刺激后,MmISG15基因的表达变化,以PBS为对照.[结果]MmISG15基因cDNA序列全长1274 bp,5'端非编码区(5'-UTR)与3'端非编码区(3'-UTR)分别为126和650 bp,开放阅读框(ORF)为498 bp,编码165个氨基酸残基,蛋白分子量为15.3 kD,理论等电点(pI)为7.70.MmISG15蛋白N端存在2个泛素样结构域(UBD),C端含有1段高度保守的LRLRGG基序.MmISG15氨基酸序列与其他爬行动物ISG15氨基酸序列相似性为55.57%～95.54%,与鱼类和哺乳动物的相似性分别为34.09%～49.02%及38.64%～48.25%.系统发育进化树显示,MmISG15和其他爬行动物ISG15聚为一支,其中与乌龟(Mauremys reevesii)亲缘关系最近.实时荧光定量PCR检测结果表明,MmISG15基因在健康黄喉拟水龟8种组织中均有表达,在脾脏组织中相对表达量最高,其次是肝脏,在前肠、后肠、肾脏、肺和肌肉组织中的相对表达量较低,而在脑组织中的相对表达量最低;LPS刺激后黄喉拟水龟脾脏和肝脏组织中MmISG15基因相对表达量与对照无显著差异(P>0.05);Poly(I∶C)刺激后6 h脾脏和肝脏组织中MmISG15基因相对表达量极显著上调(P<0.01,下同)并在刺激后12 h达最大值;肺炎克雷伯氏菌刺激后12 h脾脏和肝脏组织中MmISG15基因相对表达量极显著上调并在刺激后48 h达最大值.[结论]MmISG15属于典型泛素样蛋白,MmISG15基因主要在黄喉拟水龟脾脏和肝脏组织中表达.Poly(I∶C)和肺炎克雷伯氏菌刺激能提高脾脏和肝脏中MmISG15基因的相对表达量,推测MmISG15基因参与黄喉拟水龟抵抗病毒和细菌侵袭的免疫反应,其编码蛋白发挥重要免疫功能.

    黄喉拟水龟ISG15抗病免疫组织表达RACE实时荧光定量PCR

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    宽体金线蛭源维氏气单胞菌的分离鉴定及其生物学特性分析

    祝林覃晓曼刘峰苏应兵...
    3474-3486页
    查看更多>>摘要：[目的]对引起湖北省荆州市太湖养殖基地宽体金线蛭急性死亡的病原菌进行分离鉴定,并分析其生物学特性,为病害防治提供理论依据,促进宽体金线蛭养殖业健康发展.[方法]从患病宽体金线蛭病变组织中分离细菌并进行人工感染试验,通过形态学观察、生理生化特性鉴定、16S rRNA序列分析、多位点序列分型(MLST)等方法确定其分类地位.同时,通过PCR检测分离菌株的毒力基因和耐药基因携带情况,采用纸片扩散法测定其药物敏感性,并进行中药抑菌试验.[结果]从患病的宽体金线蛭病变组织中分离到菌株W23,人工感染试验结果表明分离菌株W23具有较高致病性,通过形态学观察和生理生化特性鉴定初步判断其为维氏气单胞菌(Aeromonas veronii),16S rRNA序列分析结果表明,分离菌株W23与维氏气单胞菌参考菌株具有高度相似性,并在系统发育进化树中与其聚为一支.毒力基因和耐药基因检测结果表明,分离菌株W23携带whiB3、Fla、Act、Lip、Aer、Ela共6种毒力基因和blaTEM、tetA、qnrS共3种耐药基因.此外,分离菌株W23具有生物被膜形成能力,对数生长期为接种后5～9 h.药敏试验结果表明,分离菌株W23对多黏菌素B、四环素和氧氟沙星等10种抗生素敏感,对头孢氨苄和复方新诺明2种抗生素中度敏感,对苯唑西林、青霉素和头孢唑林等7种抗生素具有耐药性.中药抑菌试验结果表明,乌梅、五倍子、五味子和苏木对分离菌株W23有明显抑制效果.[结论]维氏气单胞菌是引起湖北省荆州市太湖养殖基地宽体金线蛭急性死亡的病原菌,其携带6种毒力基因和3种耐药基因,具有较高的致病性.在宽体金线蛭养殖过程中可选用乌梅、五倍子、五味子和苏木对维氏气单胞菌感染引起的疾病进行防治.

    宽体金线蛭维氏气单胞菌毒力基因药物治疗多位点序列分型

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    基于随机前沿引力模型分析我国对RCEP国家蔬菜出口的影响因素及出口效率

    王雅丽胡茜茜
    3487-3496页
    查看更多>>摘要：[目的]实证分析我国对《区域全面经济伙伴关系协定》(简称RCEP)国家蔬菜出口的影响因素及出口效率,测算蔬菜出口可拓展空间,为制定产业政策及优化出口结构提供参考依据.[方法]基于2002-2022年我国对RCEP国家蔬菜出口数据,将生产函数中的前沿面引入引力模型中,同时控制传统引力模型的影响因素和非效率项的影响因素,在模型适用性检验的基础上,分别采用两步法和一步法实证分析我国对RCEP国家蔬菜出口的影响因素,并测算蔬菜出口贸易效率和出口可拓展空间.[结果]RCEP国家与我国GDP比值、RCEP国家与我国农业增加值比值、我国人均农业增加值、两国接壤、使用共同语言及签订自由贸易协定等能有效提升我国对RCEP国家的蔬菜出口规模,两国地理距离则抑制蔬菜出口规模.在贸易非效率项中,RCEP国家物流综合绩效、政治稳定性和经济自由度对贸易非效率项均呈负影响,能有效提升我国对RCEP国家的蔬菜出口效率.2002-2022年我国对RCEP国家蔬菜出口贸易效率偏低,且呈先上升后下降的波动变化趋势;我国对RCEP发展中国家的蔬菜出口贸易效率高于整体出口贸易效率,尚处于增长趋势;我国对RCEP发达国家的蔬菜出口效率则低于整体出口效率,处于下降趋势.我国对RCEP国家蔬菜出口效率较高的国家有日本、泰国、新加坡和新西兰,出口贸易效率较低的国家包括韩国、柬埔寨、老挝、缅甸和菲律宾;综合出口贸易效率及规模来看,可拓展空间较大的国家是韩国、日本、越南、缅甸和菲律宾.[建议]借助签订RCEP的契机,推进RCEP国家融合发展,提高区域内自由便利程度,以提高我国对RCEP国家蔬菜出口贸易效率;同时,根据RCEP各成员国的蔬菜消费需求差异,优化出口市场结构,最大限度地挖掘蔬菜出口潜力.

    蔬菜出口效率影响因素RCEP国家随机前沿引力模型

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    广西农业全要素生产率的时空差异及影响因素分析

    周保吉兰宗宝屈婷婷汪羽宁...
    3497-3506页
    查看更多>>摘要：[目的]测算广西农业全要素生产率(TFP)并分析其时空特征和影响因素,为推动广西农业科技创新及赋能农业强区建设提供决策依据.[方法]运用DEA-Malmquist指数法对2005-2021年广西农业全要素生产率进行测算,将其分解为技术效率和技术进步,分析其时空变化情况,构建面板数据回归模型,分析广西农业全要素生产率的影响因素,并进行稳健性检验.[结果]从时间趋势来看,2005-2021年广西农业全要素生产率稳步增长,特别是"十三五"以来增长速度明显加快,且形成了广西农业全要素生产率增长的技术进步和技术效率"双驱动"模式.从空间分布来看,广西14个地级市的农业全要素生产率增长差异较明显,其中,有11个市实现增长,增长最多的是南宁市,增长最少的是贺州市.从影响因素来看,农村人力资本、农业生产规模、农业机械化水平和财政支农水平是影响广西农业全要素生产率增长的主要因素.从与周边省份对比结果来看,广西农业全要素生产率平均增长速度落后于广东省2.3%,落后于云南省0.9%.[建议]建议广西以市场需求为导向,推动农业技术进步;以生产需求为导向,提升农业技术效率;以协调发展为导向,合理布局创新资源;以优先发展为导向,强化支农强农措施,从而加快提升农业全要素生产率,助力农业强区建设.

    农业全要素生产率时空差异影响因素农业强区广西

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