查看更多>>摘要:为探究陆川猪骨骼肌生长发育过程中MyoD1 基因所起作用,对陆川猪成肌细胞决定基因1(MyoD1)进行克隆,展开生物信息学分析,对其在陆川猪不同组织中的表达进行分析,以NCBI上已公布的野猪MyoD1 基因序列为模板,进行特异性引物设计,克隆陆川猪MyoD1 基因CDS区,并与NCBI已公布的野猪、牛、绵羊、人、小鼠、大鼠基因序列进行相似性比对,由此构建系统进化树,通过在线软件开展生物信息学分析,而后使用实时荧光定量PCR检测在陆川猪不同组织中MyoD1 基因的相对表达量.陆川猪MyoD1 基因CDS区全长960 bp,共编码319 个氨基酸,碱基突变共存在5 处,与野猪、牛、绵羊、人类、小鼠、大鼠的 MyoD1 基因 CDS 序列相似性分别为 99.2%,93.0%,92.3%,90.0%,84.3%,84.0%,其中与野猪相似性最高,表明二者亲缘关系最为接近;陆川猪MyoD1 基因原子总数为4680,蛋白的分子质量为33.99 ku,分子式为C1457 H2296 N442 O471 S14;不稳定系数为63.87,表明其缺乏稳定性;等电点为5.63,属于酸性蛋白;不存在跨膜结构,存在 35 处磷酸化位点及 1 处糖基化位点;蛋白二级结构以无规则卷曲为主,占比60.69%.陆川猪MyoD1 基因在背最长肌中的表达量最高,且显著高于其他组织,表达量最低的组织为肾脏.陆川猪各组织中均有MyoD1 基因表达,且主要在背最长肌中表达,由此推测,MyoD1 基因在陆川猪肌肉生长发育过程中可能起到至关重要的作用.