查看更多>>摘要:[目的]葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)在植物响应非生物胁迫中发挥重要作用,鉴定马铃薯中G6PDH基因家族,并分析其在损伤块茎的表达模式,为深入研究马铃薯G6PDH基因在损伤胁迫中的作用提供参考.[方法]利用生物信息学对马铃薯G6PDH基因家族进行鉴定,并对该基因家族成员编码蛋白的染色体分布、蛋白理化性质和二级结构、进化关系、基因结构、保守基序和启动子顺式作用元件,以及在不同器官和损伤块茎中的表达模式进行分析.[结果]在马铃薯基因组中共鉴定到 4 个StG6PDHs家族成员,分别分布在 4 条染色体上,命名为StG6PDH1-StG6PDH4.根据亚细胞定位和系统进化分析,StG6PDH1、StG6PDH3 和StG6PDH4 位于叶绿体,属于质体型;StG6PDH2 位于细胞质,属于胞质型.马铃薯G6PDH蛋白的氨基酸个数介于 511-596 aa,分子量为 58.48-66.65 kD,等电点为 5.83-8.57,不稳定系数为 39.79-47.53.蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲占比最多,β-转角最少.此外,StG6PDHs启动子含大量植物激素、光和胁迫响应元件.4 个StG6PDHs在马铃薯根、茎、叶和块茎均有表达,且在叶片中的表达高于其他组织.StG6PDHs各成员共同参与马铃薯块茎对损伤胁迫的响应,其中,StG6PDH1、StG6PDH2 和StG6PDH3 在块茎损伤后 36 h内上调表达,StG6PDH4 在损伤后下调表达.[结论]在马铃薯中共鉴定出4 个StG6PDHs基因家族成员,不均匀地分布于 4 条染色体上,其中,1 个为胞质型,3 个为质体型.StG6PDHs启动子区有光、激素和胁迫响应元件.损伤块茎中StG6PDHs的表达具有差异性,各成员协同调控了马铃薯块茎对损伤胁迫的应答.