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期刊信息/Journal information
畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会
畜牧兽医学报

中国畜牧兽医学会

文杰

月刊

0366-6964

xmsyxb@263.net

010-62815987 62816996 62893836

100193

北京海淀区圆明园西路2号

畜牧兽医学报/Journal Acta Veterinaria Et Zootechnica SinicaCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本学报是中国畜牧兽医学会主办，《畜牧兽医学报》编委会、中国农业科学院畜牧研究所编辑出版的全国性的畜牧兽医学术刊物。创刊于1956年7月，刊登较高水平的学术论文和企业研究报告以及对生产实践具指导性、启发性的文章。为全国中文核心期刊、中国自然科学核心期刊，并被国内外重要引文数据库及文摘性期刊收录。主要栏目包括畜牧和兽医两大学科。
正式出版
收录年代

    整合生物学先验信息的全基因组选择方法及其在家畜育种中的应用进展

    袁泽湖葛玲李发弟乐祥鹏...
    3323-3334页
    查看更多>>摘要：相较于传统的育种方法,全基因组选择(genomic selection,GS)通过对拟留种的个体进行早期选择和增加选择的准确性进而加快育种的遗传进展.通过改进GS方法无法再缩短育种的世代间隔,因而如何提高GS的准确性以获得额外的遗传进展一直是GS研究的核心问题.当前,各种组学技术不断成熟,从公开的资料或前期的研究积累获取生物学先验信息已比较容易.因而,如何在GS模型中整合已知的先验信息进而提高GS的准确性以获得额外的遗传进展成为当前育种研究的热点问题.本文对生物学先验信息的类型以及整合先验信息的GS方法进行综述,探讨了这些方法在家畜育种中的应用和前景,以期为家畜育种中开展整合生物学先验信息的GS研究提供借鉴与参考.

    生物学先验信息全基因组选择家畜育种多组学

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    超级增强子调控基因表达的生物学作用及其在哺乳动物中的应用前景

    赵磊康晓龙
    3335-3345页
    查看更多>>摘要：超级增强子是一类包含多个普通增强子的大簇,主要富集高密度的转录因子、辅助因子及增强子相关表观修饰位点.与普通增强子相比,超级增强子具有更高的转录激活能力,在细胞类型特异性发育、分化以及肿瘤的发展进程中发挥关键作用.研究超级增强子在基因转录过程中的作用机制,对于揭示哺乳动物表型性状的分子机理具有十分重要的生物学意义.本文概述了超级增强子的概念、特性及鉴定方法,总结了超级增强子发挥作用的主要机制,最后对超级增强子调控动物重要表型的研究进展进行综述,并且结合超级增强子在哺乳动物方面的最新研究进展,讨论了其在哺乳类动物中的应用前景,旨在为超级增强子在动物重要性状表型研究中提供参考.

    超级增强子转录调控启动子增强子相变非编码RNA

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    动物氧化应激及其营养调控措施研究进展

    储蓄张军霞王晶
    3346-3356页
    查看更多>>摘要：动物机体内存在氧化还原平衡,正常状态下保持相对的稳态,当环境或自身状态发生改变时,这种平衡可能会被打破,进而引发机体氧化应激.研究发现,引起氧化应激的因素有很多:如环境因素、动物自身状态改变和外源致病菌以及病毒等,这些因素造成的氧化应激对动物的健康状况、生产性能和繁殖功能等方面会产生不同程度的影响,严重时甚至引发动物死亡,因此,寻求和添加安全有效的抗氧化制剂以调节动物氧化还原状态具有重要的现实意义.目前,针对动物氧化应激的营养性添加剂主要有益生菌、维生素、微量元素、激素类和植物类活性物质等.本文对引发动物氧化应激的主要原因和其对动物产生的影响进行了总结,并概括了具有缓解动物氧化应激功能的营养性饲料添加剂,以期为动物氧化应激和其缓解策略的进一步研究提供参考.

    动物氧化应激应激因素应激影响营养调控抗氧化剂

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    参考群筛选方法及规模对基因型填充准确性的影响

    阳文攀叶绍潘叶浩强林清...
    3357-3365页
    查看更多>>摘要：为探究基于A矩阵期望遗传关系最大化(maximizing the expected genetic relationship for matrix A,RELA)、基于A矩阵目标群体遗传方差最小化(minimized the target population genetic variance for matrix A,MCA)、平均亲缘关系最大化(the highest mean kinship coefficients,KIN)、随机选择(random selection,RAN)、共同祖先筛选(common ancestor,CA)等不同参考群筛选方法及参考群规模对基因型填充准确性的影响.本研究使用矮小型黄羽肉鸡作为试验群体,采用鸡600K SNP芯片(Affymetrix Axion HD genotyping array)进行基因分型,测定435羽子代公鸡45、56、70、84、91日龄体重.利用Beagle软件将低密度SNP芯片填充为高密度SNP芯片数据,比较不同参考群筛选方法、参考群规模对基因型填充准确性的影响,以及填充芯片基因组预测准确性.结果 表明,使用Beagle 4.0结合系谱信息进行填充效果最佳,其次为Beagle 4.0,而Beagle 5.1填充效果最差.使用MCA方法筛选参考群进行基因型填充准确性最高,使用RAN方法筛选参考群进行基因型填充准确性最低,MCA、RELA、CA 3种方法基因型填充准确性差别较小.相比其他方法,使用MCA方法筛选个体作为参考群将低密度SNP芯片填充至高密度SNP芯片进行基因组选择的预测准确性较高,与真实高密度SNP芯片的基因组预测准确性相差甚微.随着参考群规模增大,基因型填充准确性也随之增加,但增速逐渐下降,最后趋于平缓.综上所述,可以通过参考群筛选方法构建参考群以及控制参考群规模,以保证基因型填充和基因组预测准确性并节省成本,本研究为基因型填充在畜禽遗传育种中的应用提供技术参考.

    鸡基因型填充参考群筛选方法参考群规模填充准确性

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    海兰褐蛋鸡ZP3基因结构及其在卵泡中表达规律分析

    朱帅鹏王东雪刘聪孙君卫...
    3366-3374页
    查看更多>>摘要：旨在探讨ZP3基因在海兰褐蛋鸡中的表达特性,为后期研究ZP3基因在蛋鸡卵泡发育中的作用提供理论支撑.本研究以产蛋期50周龄(50 W)海兰褐蛋鸡为试验对象,利用RACE技术克隆ZP3基因全长,并对编码区进行生物信息学分析.选择健康、体重相近的海兰褐蛋鸡6只,分别取心、肝、肺、肾、卵巢、胸肌、腿肌和不同等级卵泡构建表达谱.卵巢颗粒细胞经不同浓度(PBS、5 ng·mL-1、10 ng·mL-1、20 ng·mL-1)促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)处理后,提取总RNA,采用实时荧光定量检测ZP3基因在各个样品的表达水平.结果 表明,鸡ZP3基因全长1415 bp,其中编码区1341 bp,共编码446个氨基酸,位于10号染色体上,包含9个外显子;其亲缘关系与猪最远;跨膜结构预测表示,其含有一个跨膜结构域和一个信号肽区域;对其亲疏水性进行分析,预测该蛋白为弱的疏水性蛋白,蛋白质结构主要由无规则卷曲构成.组织表达谱显示,ZP3基因在鸡的卵巢中相对表达量最高.各等级卵泡ZP3表达分析显示,随着卵泡发育,ZP3基因在成熟卵泡(F1)颗粒细胞层表达量最高;在使用FSH处理等级颗粒细胞后,发现ZP3表达量显著上调(P＜0.05),暗示ZP3基因在颗粒细胞中受到FSH激素调节.本试验对ZP3基因的结构进行了分析并预测该基因存在跨膜结构和信号肽区域.基因表达谱分析结果显示,ZP3基因在卵泡发育过程中表达量逐渐升高且主要在颗粒细胞中表达,可能受到FSH的调节作用,因此预测,ZP3基因可能与海兰褐蛋鸡繁殖功能相关.

    海兰褐蛋鸡ZP3基因基因克隆生物信息学组织表达谱

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    鸡脂肪组织TCF21基因启动子区DNA甲基化与其表达的关系

    刘雨萌马艳艳姜海煦张心扬...
    3375-3389页
    查看更多>>摘要：旨在研究鸡脂肪组织中TC F21基因启动子区DNA甲基化水平与其表达的关系.以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第24世代7周龄肉鸡为试验材料,利用RT-qPCR检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因的mRNA表达水平;利用生物信息学和双荧光素酶报告系统分析TCF21基因启动子的结构与功能;利用Sequenom MassARRAY飞行质谱检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因启动子区CpG位点的甲基化水平;利用CpG甲基转移酶处理TCF21启动子报告基因质粒,分析DNA甲基化对TCF21基因启动子活性的影响.结果 显示,高脂系肉鸡腹部脂肪组织中TC F21基因的mRNA表达水平极显著高于低脂系(P＜0.001);TCF21基因的启动子区存在40个CpG位点,且在启动子的近端和远端均有分布,但不存在CpG岛;将TCF21基因的启动子划分为5个功能区域,分别为R1区域(-2000～-1500 bp)、R2区域(-1500～-1000 bp)、R3区域(-1000～-500 bp)、R4区域(-500～-200 bp)和Core区域(-200～-100 bp);高脂系R2、R3和R2+ R3区域的DNA甲基化水平显著或极显著高于低脂系(P＜0.05或P＜0.001);R2、R3、R2+R3区域的DNA甲基化水平与TCF21基因mRNA表达水平呈显著正相关(R2区域:r=0.438,P＜0.05;R3区域:r=0.371,P＜0.05;R2+ R3区域:r=0.489,P＜0.05);R2区域的DNA甲基化显著抑制其转录活性(P＜0.05).综上所述,TCF21基因在高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中的表达水平主要与其启动子R2区域的DNA甲基化水平有关.

    鸡TCF21基因启动子DNA甲基化基因表达脂肪组织

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    皱皮香猪HAS2基因SNPs的鉴定及生物信息学分析

    吴行雕石道宏黄世会牛熙...
    3390-3402页
    查看更多>>摘要：为了探究皱皮香猪全身性皮肤褶皱是否与透明质酸合成酶2 (hyaluronan synthase 2,HAS2)基因变异有关,本研究以普通香猪为对照,采用特异性PCR方法克隆HAS2基因的外显子编码区,应用生物信息学方法分析测定基因编码区的碱基变异,检测变异位点在群体中的分布频率.结果 显示,皱皮香猪HAS2基因中检测到4个SNPs位点:位于外显子1的T221A错义突变(导致亮氨酸替换为赖氨酸)和A228G同义突变,位于外显子2的T183C和外显子4的C537T同义突变.生物信息学分析发现,T221A和A228G位点构成4种单倍型,其中T-A为皱皮香猪群体的主要单倍型(27.5％),且在皱皮香猪群体中紧密连锁(r2=0.253),而且T221A和A228G突变可引起mRNA自由能和蛋白质结构发生变化,TA组合的自由能为-573.29 kJ·mol-1,TG组合的自由能为-580.89 kJ· mol-1,AG组合的自由能为-572.66 kJ·mol-1;AA组合的自由能为-571.03 kJ·mol-1;蛋白序列中亮氨酸替换为赖氨酸后,α螺旋由35.52％降为32.97％,自由卷曲由43.17％升至44.51％,同时引起蛋白序列三级结构的改变.位点T221A和A228G在香猪群体中呈现出丰富的多态性,均表现出3种基因型;关联分析结果显示,皱皮香猪T221A位点的A等位基因频率显著高于普通香猪(P＜0.05),A228G位点中皱皮香猪的G等位基因频率极显著高于普通香猪(P＜0.01).T183C位点的C等位基因频率和C537T位点的T等位基因频率在皱皮香猪和普通香猪间未达到显著性差异(P＞0.05).研究结果揭示,HAS2基因的外显子1中发生的两个碱基变异可能影响基因转录后mRNA的稳定性以及蛋白的三维结构,影响HA的合成量,并与皱皮香猪体侧皮肤不均匀增厚且发生褶皱有关.

    皱皮香猪透明质酸酶SNPs基因型皮肤褶皱

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    多浪羊与小尾寒羊皮下脂肪组织转录组分析

    刘天义冯卉Salsabeel Yousuf解领丽...
    3403-3412页
    查看更多>>摘要：旨在探索多浪羊(D组)与小尾寒羊(X组)皮下脂肪组织中的特异性表达基因,并研究其潜在的作用,为理解绵羊脂肪组织发育规律以及对脂代谢相关疾病的预防和治疗研究提供依据.本研究选取脂肪沉积能力存在差异、健康无病、体况良好、种内个体体重相近(约50 kg)的雌性成年多浪羊和小尾寒羊为试验材料,分为D组(试验组)和X组(对照组),每组3个重复,采集位于背最长肌的皮下脂肪组织,应用RNA-Seq技术和生物信息学方法进行转录组测序并对结果进行分析.以|Fold change|≥2,P adjust≤0.05为标准筛选差异表达基因,通过对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,得到与脂肪沉积和脂代谢有关的差异基因.为了验证测序数据的可靠性,本研究随机选取了6个差异表达基因进行qRT-PCR验证.结果 显示,在6个样本中共检测到38672个已知的mRNAs,新的mRNAs为1606个,在两组中共有839个差异表达基因,其中有320个差异基因在多浪羊组中上调表达,有519个差异基因在多浪羊组中下调表达.通过GO功能注释分析发现,差异表达基因主要参与脂质分解代谢过程、脂质生物合成过程、脂质分解代谢负调控过程、MAPK级联反应调控、对甘油三酯的反应等生物学过程.KEGG通路富集结果显示,差异表达基因显著富集到了PI3K-Akt、MAPK、胰岛素以及PPAR等信号通路中.qRT-PCR结果与测序结果一致,表明测序结果可靠.通过对多浪羊和小尾寒羊皮下脂肪组织进行转录组测序以及生物信息学分析,筛选到与脂肪沉积和脂代谢相关的差异表达基因,这些基因主要参与脂质生物合成、脂质代谢等过程,其中COL1A1、AKT2、SCD、LPL、PCK1与PPP2R5A可能在多浪羊与小尾寒羊的皮下脂肪组织的沉积与代谢中发挥重要作用.

    mRNA皮下脂肪脂肪沉积脂质代谢绵羊

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    藏羊HSP27基因过表达和沉默载体构建及对卵泡发育的功能初步分析

    张春梅贾建磊谢雯任昊...
    3413-3425页
    查看更多>>摘要：为了深入探究HSP27基因在藏羊卵泡发育过程中的作用,本研究选择健康的(3～4岁)经产藏母羊6只,屠宰获得卵巢组织进行藏羊HSP27基因克隆,利用生物信息学方法分析HSP27基因CDS区序列,构建HSP27基因过表达及沉默载体,分离培养藏羊卵巢颗粒细胞,将构建的载体按不同分组进行细胞转染试验即空白组、过表达载体组、沉默载体组、阴性对照组,每组设3个复孔.显微镜观察各转染组培养0、24、48、72 h的细胞形态变化及细胞计数,RT-PCR检测各转染组HSP27、GDF9、BMPR-1B、Erβ基因mRNA表达量.结果 ,试验成功克隆藏羊HSP27基因,其CDS序列长度为618 bp,编码203个氨基酸.试验成功构建藏羊HSP27基因过表达及沉默载体;将构建的载体转染至卵巢颗粒细胞,随着培养时间的递增各转染组间细胞形态发生改变,过表达载体组细胞由长梭状逐渐变为不规则多边形,细胞核变形分解,沉默载体组细胞周边伪足伸出减少,细胞皱缩大量凋亡;细胞计数结果显示,转染后培养72 h时,沉默载体组细胞数量极显著低于其他3组(P＜0.01),过表达载体组细胞数量显著低于空白组和阴性对照组(P＜0.05).RT-PCR结果显示,过表达载体组细胞HSP27基因mRNA表达量极显著高于空白组(P＜0.01),沉默载体组细胞HSP27基因mRNA表达量极显著低于阴性对照组(P＜0.01),过表达载体组细胞的GDF9、BMPR-1B、Erβ基因mRNA表达量均极显著高于空白组(P＜0.01),沉默载体组细胞EO基因mRNA表达量极显著低于阴性对照组(P＜0.01).由此可初步推测,当HSP27基因过表达时能够促进颗粒细胞增殖分化,当沉默HSP27基因时可能会触发颗粒细胞凋亡进而影响卵泡发育,以上研究成果可为HSP27基因在藏羊卵泡发育过程中的功能研究奠定试验基础.

    藏羊热休克蛋白27基因克隆序列分析载体构建卵泡发育

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    山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测

    王宪军向华张焕容任玉鹏...
    3426-3438页
    查看更多>>摘要：旨在克隆简州山羊HABP4基因,鉴定与HABP4互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探讨HABP4基因在调控山羊细胞凋亡中的作用奠定基础.于四川省简阳大哥大牧业有限公司随机选取10月龄左右,体重为55 kg左右的健康简州大耳羊公羊(16只),清晨空腹屠宰后迅速采集各山羊心、肝、脾、肺、肾、小肠、大肠、瘤胃和胰腺9个组织样本,TRIzol法提取组织总RNA,并反转录cDNA.RT-PCR技术克隆山羊HABP4基因cDNA序列,利用在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR (RT-qPCR)技术检测HABP4基因在不同组织中的表达量(n=16)以及分析在胰腺(n=16)组织中与该HABP4蛋白可能存在相互作用的10个蛋白的mRNA表达特性及其相关性.结果 ,成功扩增山羊HABP4基因1496 bp,包含5'UTR 61 bp,CDS区1254 bp,3'UTR 181 bp,编码417个氨基酸残基.HABP4 mRNA在山羊各组织中均有表达,在胰腺中表达水平最高,且与UAB52呈极显著正相关,和RPL32、RPS9呈显著正相关,推测其在细胞定位、新陈代谢、多生物过程及生物过程负调节以及翻译起始、核糖体转录、细胞质代谢等方面发挥着重要作用.本研究成功克隆山羊HABP4基因cDNA全长1496 bp,其可能与UAB52、RPL32和RPS9呈显著正相关.这些结果也为进一步探讨HABP4在调控细胞凋亡过程中的作用提供了参考数据.

    山羊HABP4克隆表达特性功能预测

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