畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(12) :3426-3438.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.012.010

山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测

Cloning,Sequence Analysis and Function Prediction of HABP4 Gene in Goat

王宪军 向华 张焕容 任玉鹏 朱江江
畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(12) :3426-3438.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.012.010

山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测

Cloning,Sequence Analysis and Function Prediction of HABP4 Gene in Goat

王宪军 1向华 1张焕容 1任玉鹏 1朱江江2
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作者信息

  • 1. 西南民族大学畜牧兽医学院,成都610041
  • 2. 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室,成都610041
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摘要

旨在克隆简州山羊HABP4基因,鉴定与HABP4互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探讨HABP4基因在调控山羊细胞凋亡中的作用奠定基础.于四川省简阳大哥大牧业有限公司随机选取10月龄左右,体重为55 kg左右的健康简州大耳羊公羊(16只),清晨空腹屠宰后迅速采集各山羊心、肝、脾、肺、肾、小肠、大肠、瘤胃和胰腺9个组织样本,TRIzol法提取组织总RNA,并反转录cDNA.RT-PCR技术克隆山羊HABP4基因cDNA序列,利用在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR (RT-qPCR)技术检测HABP4基因在不同组织中的表达量(n=16)以及分析在胰腺(n=16)组织中与该HABP4蛋白可能存在相互作用的10个蛋白的mRNA表达特性及其相关性.结果 ,成功扩增山羊HABP4基因1496 bp,包含5'UTR 61 bp,CDS区1254 bp,3'UTR 181 bp,编码417个氨基酸残基.HABP4 mRNA在山羊各组织中均有表达,在胰腺中表达水平最高,且与UAB52呈极显著正相关,和RPL32、RPS9呈显著正相关,推测其在细胞定位、新陈代谢、多生物过程及生物过程负调节以及翻译起始、核糖体转录、细胞质代谢等方面发挥着重要作用.本研究成功克隆山羊HABP4基因cDNA全长1496 bp,其可能与UAB52、RPL32和RPS9呈显著正相关.这些结果也为进一步探讨HABP4在调控细胞凋亡过程中的作用提供了参考数据.

关键词

山羊/HABP4/克隆/表达特性/功能预测

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基金项目

四川省科技计划(2020JDJQ0010)

四川省畜禽育种攻关项目(2021YFYZ0003)

西南民族大学优秀学术培养工程项目(2021 NYYXS95)

出版年

2021
畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.729
ISSN:0366-6964
被引量4
参考文献量9
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